24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2961  |  回复: 5

阿黛拉

银虫 (小有名气)


[交流] 有关vasp中dimer方法的交流

dimer :method for finding reaction pathways when only one state is known。

虽然计算时仅需一种状态被确定,但是MODECAR(设计需要2个POSCAR)最好给出。
如果不被给出,则计算按自由的方向进行。

有关dimer的脚本还有
diminit.pl       

usage: diminit.pl (DIR or number)
                  (DisplaceAlgo) (DisplaceRange) (Rcut)
                  (MaxCord) (POSCAR) (DISPLACECAR_sp)
output: DIR or prXXXX containing files for dimer runs

Generates an initialized dimer run in DIR or the numbered directories prXXXX, from a POSCAR and DISPLACECAR


dimmins.pl       

usage: dimmins.pl (POSCAR1) (POSCAR2) (displacement)
output: mins/min1/POSCAR mins/min2/POSCAR (and related files)


Generates initial configurations which can be minimized from a converged dimer run.

对于这两个脚本希望大家多多交流。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿黛拉(金币+1):谢谢参与
这个帖子没有人回复?
2楼2011-08-18 20:59:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-08-19 16:42:05
dimer方法的物理意义我不明白:

NEB是找能量面上的一条MEP。dimer是两个点,这两个点书虚拟的,没有质量,只有坐标?是能量面上的一对点?

dimer收敛到过渡态的时候,七方向跟虚频的方向一致。请问虚频的方向是什么意思?
3楼2011-08-18 21:03:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanghui381

金虫 (小有名气)



阿黛拉(金币+1):谢谢参与
关注。。正在尝试dimer方法,做出的结果总不理想,不知参数设置细节有没有什么说法,效率是不是比CINEB高?
4楼2011-11-23 14:46:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

无知!无畏?

木虫 (正式写手)


跟着大神学习
5楼2019-02-26 21:29:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianghuaih

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
各位能留个联系方式吗?我也刚做这个,想请教些问题。
6楼2019-05-06 15:01:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 阿黛拉 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 280求调剂 +4 兮兮夜夜 2026-04-09 5/250 2026-04-09 09:02 by 兮兮夜夜
[考研] 材料专硕调剂 +15 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-07 16/800 2026-04-09 08:33 by byk122723822
[考研] 材料307分求大佬组收留 +16 Hll胡 2026-04-07 16/800 2026-04-09 07:51 by 5268321
[考研] 315求调剂 +17 欣喜777 2026-04-04 18/900 2026-04-08 13:54 by hangsimei
[考研] 0703化学调剂325分 +13 15771691647 2026-04-04 14/700 2026-04-08 10:28 by screening
[考研] 调剂求助(生物与医药) +6 @6952 2026-04-06 6/300 2026-04-07 23:52 by lys0704
[考研] 材料工程专业日语生求调剂 +9 111623 2026-04-07 9/450 2026-04-07 23:31 by 一只好果子?
[考研] 344求调剂 +11 魏子per 2026-04-07 11/550 2026-04-07 23:01 by JourneyLucky
[考研] 调剂 +18 不逢春 2026-04-05 19/950 2026-04-07 22:04 by lijunpoly
[考研] 312求调剂 +18 gtw1 2026-04-06 20/1000 2026-04-07 18:16 by 蓝云思雨
[考研] 285求调剂 +5 mapmath 2026-04-06 6/300 2026-04-06 17:18 by 蓝云思雨
[考研] 0857大类环境工程B区求调剂 +3 龚禹铭 2026-04-05 3/150 2026-04-06 10:22 by 蓝云思雨
[考研] 材料调剂 +14 壹贰贰亿 2026-04-04 14/700 2026-04-05 23:31 by 来看流星雨10
[考研] 313求调剂 +5 海日海日 2026-04-04 7/350 2026-04-05 13:58 by imissbao
[考研] 271分求调剂学校 +12 zph158488! 2026-04-02 13/650 2026-04-05 10:13 by lqwchd
[考研] 考研调剂 +5 小sun要好运 2026-04-03 5/250 2026-04-03 21:43 by 啵啵啵0119
[考研] 281求调剂 +10 aaawhy 2026-04-03 10/500 2026-04-03 21:42 by lbsjt
[考研] 调剂 +7 祉岷. 2026-04-02 7/350 2026-04-03 09:11 by 花呗还欠600
[考研] 372分材料与化工(085600)一志愿湖南大学求调剂 +5 蓝笺片 2026-04-02 6/300 2026-04-02 21:37 by dongzh2009
[考研] 293求调剂 +4 珂珂乐 2026-04-02 4/200 2026-04-02 20:10 by 6781022
信息提示
请填处理意见