应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 有关vasp中dimer方法的交流
61/1返回列表
查看: 3180  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

阿黛拉

银虫 (小有名气)

[交流] 有关vasp中dimer方法的交流

dimer ：method for finding reaction pathways when only one state is known。

虽然计算时仅需一种状态被确定，但是MODECAR（设计需要2个POSCAR）最好给出。
如果不被给出，则计算按自由的方向进行。

有关dimer的脚本还有
diminit.pl       

usage: diminit.pl (DIR or number)
                  (DisplaceAlgo) (DisplaceRange) (Rcut)
                  (MaxCord) (POSCAR) (DISPLACECAR_sp)
output: DIR or prXXXX containing files for dimer runs

Generates an initialized dimer run in DIR or the numbered directories prXXXX, from a POSCAR and DISPLACECAR


dimmins.pl       

usage: dimmins.pl (POSCAR1) (POSCAR2) (displacement)
output: mins/min1/POSCAR mins/min2/POSCAR (and related files)


Generates initial configurations which can be minimized from a converged dimer run.

对于这两个脚本希望大家多多交流。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-05-30 11:06:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★
阿黛拉(金币+1):谢谢参与
这个帖子没有人回复？
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-08-18 20:59:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-08-19 16:42:05
dimer方法的物理意义我不明白:

NEB是找能量面上的一条MEP。dimer是两个点，这两个点书虚拟的，没有质量，只有坐标？是能量面上的一对点？

dimer收敛到过渡态的时候，七方向跟虚频的方向一致。请问虚频的方向是什么意思？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-08-18 21:03:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanghui381

金虫 (小有名气)
★
阿黛拉(金币+1):谢谢参与
关注。。正在尝试dimer方法，做出的结果总不理想，不知参数设置细节有没有什么说法，效率是不是比CINEB高？
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-11-23 14:46:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

无知！无畏？

木虫 (正式写手)
跟着大神学习
回复此楼
5楼2019-02-26 21:29:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianghuaih

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
各位能留个联系方式吗？我也刚做这个，想请教些问题。
赞一下 回复此楼
6楼2019-05-06 15:01:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 阿黛拉 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于代码变化问题，想知道的进来 +6 且听虎啸 2026-08-07 9/450 2026-08-07 18:40 by naalan7001
[基金申请] 关于filecode +3 布布和一二 2026-08-07 6/300 2026-08-07 17:51 by 医学老男孩
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了，论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] 面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！ +23 低垂的野花 2026-07-31 31/1550 2026-08-07 12:22 by speculiar
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 8月时间戳变的，举个手。玩一下，释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息？这个有何含义？？？ +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的？有收到消息的吗？ +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐，不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息，有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 娱乐 +4 Tide man 2026-08-03 4/200 2026-08-04 11:51 by wgch518
[基金申请] 什么时候能放榜呀？ +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭