应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 有关vasp中dimer方法的交流
61/1返回列表
查看: 3198  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

阿黛拉

银虫 (小有名气)

[交流] 有关vasp中dimer方法的交流

dimer ：method for finding reaction pathways when only one state is known。

虽然计算时仅需一种状态被确定，但是MODECAR（设计需要2个POSCAR）最好给出。
如果不被给出，则计算按自由的方向进行。

有关dimer的脚本还有
diminit.pl       

usage: diminit.pl (DIR or number)
                  (DisplaceAlgo) (DisplaceRange) (Rcut)
                  (MaxCord) (POSCAR) (DISPLACECAR_sp)
output: DIR or prXXXX containing files for dimer runs

Generates an initialized dimer run in DIR or the numbered directories prXXXX, from a POSCAR and DISPLACECAR


dimmins.pl       

usage: dimmins.pl (POSCAR1) (POSCAR2) (displacement)
output: mins/min1/POSCAR mins/min2/POSCAR (and related files)


Generates initial configurations which can be minimized from a converged dimer run.

对于这两个脚本希望大家多多交流。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-05-30 11:06:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★
阿黛拉(金币+1):谢谢参与
这个帖子没有人回复？
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-08-18 20:59:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-08-19 16:42:05
dimer方法的物理意义我不明白:

NEB是找能量面上的一条MEP。dimer是两个点，这两个点书虚拟的，没有质量，只有坐标？是能量面上的一对点？

dimer收敛到过渡态的时候，七方向跟虚频的方向一致。请问虚频的方向是什么意思？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-08-18 21:03:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanghui381

金虫 (小有名气)
★
阿黛拉(金币+1):谢谢参与
关注。。正在尝试dimer方法，做出的结果总不理想，不知参数设置细节有没有什么说法，效率是不是比CINEB高？
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-11-23 14:46:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

无知！无畏？

木虫 (正式写手)
跟着大神学习
回复此楼
5楼2019-02-26 21:29:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianghuaih

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
各位能留个联系方式吗？我也刚做这个，想请教些问题。
赞一下 回复此楼
6楼2019-05-06 15:01:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 阿黛拉 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 不应该看fileCode +5 且听虎啸 2026-08-12 5/250 2026-08-12 16:19 by 云上清扬
[基金申请] 好奇怪的filecode +5 布布和一二 2026-08-08 6/300 2026-08-12 16:11 by 云上清扬
[基金申请] 长年满屏的广告，版主太不责任了。基金也等的急 +4 gltch 2026-08-12 4/200 2026-08-12 16:08 by eulota
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +4 majunge000 2026-08-10 4/200 2026-08-12 15:46 by 云上清扬
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭