24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2985  |  回复: 5

阿黛拉

银虫 (小有名气)


[交流] 有关vasp中dimer方法的交流

dimer :method for finding reaction pathways when only one state is known。

虽然计算时仅需一种状态被确定,但是MODECAR(设计需要2个POSCAR)最好给出。
如果不被给出,则计算按自由的方向进行。

有关dimer的脚本还有
diminit.pl       

usage: diminit.pl (DIR or number)
                  (DisplaceAlgo) (DisplaceRange) (Rcut)
                  (MaxCord) (POSCAR) (DISPLACECAR_sp)
output: DIR or prXXXX containing files for dimer runs

Generates an initialized dimer run in DIR or the numbered directories prXXXX, from a POSCAR and DISPLACECAR


dimmins.pl       

usage: dimmins.pl (POSCAR1) (POSCAR2) (displacement)
output: mins/min1/POSCAR mins/min2/POSCAR (and related files)


Generates initial configurations which can be minimized from a converged dimer run.

对于这两个脚本希望大家多多交流。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿黛拉(金币+1):谢谢参与
这个帖子没有人回复?
2楼2011-08-18 20:59:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-08-19 16:42:05
dimer方法的物理意义我不明白:

NEB是找能量面上的一条MEP。dimer是两个点,这两个点书虚拟的,没有质量,只有坐标?是能量面上的一对点?

dimer收敛到过渡态的时候,七方向跟虚频的方向一致。请问虚频的方向是什么意思?
3楼2011-08-18 21:03:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanghui381

金虫 (小有名气)



阿黛拉(金币+1):谢谢参与
关注。。正在尝试dimer方法,做出的结果总不理想,不知参数设置细节有没有什么说法,效率是不是比CINEB高?
4楼2011-11-23 14:46:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

无知!无畏?

木虫 (正式写手)


跟着大神学习
5楼2019-02-26 21:29:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianghuaih

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
各位能留个联系方式吗?我也刚做这个,想请教些问题。
6楼2019-05-06 15:01:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 阿黛拉 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 297,工科调剂? +11 河南农业大学-能 2026-04-14 11/550 2026-04-19 20:07 by Equinoxhua
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 6/300 2026-04-19 13:00 by Aaron_zyn
[考研] 307中医考研调剂 +9 于以采蘩 2026-04-14 9/450 2026-04-19 08:41 by 烟雨流涯
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 一志愿沪9,326求生物学调剂 +12 刘墨墨 2026-04-13 12/600 2026-04-18 23:31 by 路病情
[考研] 297,工科调剂? +5 河南农业大学-能 2026-04-14 5/250 2026-04-18 15:17 by Equinoxhua
[考研] 22408 312求调剂 +24 门路摸摸 2026-04-14 26/1300 2026-04-18 13:04 by wunaiy88
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考研] 急需调剂 +9 绝不放弃22 2026-04-15 10/500 2026-04-18 08:09 by chixmc
[考研] 一志愿沪9,生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[基金申请] RY:中国产出的科学垃圾论文,绝对数量和比例都世界第一 +7 zju2000 2026-04-14 18/900 2026-04-16 11:36 by 欢乐颂叶蓁
[考研] 药学求调剂 +14 喽哈加油 2026-04-14 16/800 2026-04-16 10:15 by beilsong20
[考研] 一志愿A区211,22408 321求调剂 +6 随心所欲☆ 2026-04-15 7/350 2026-04-15 21:45 by lbsjt
[考研] 085801电气专硕272求调剂 +19 电气李 2026-04-13 21/1050 2026-04-15 13:37 by 黑科技矿业
[教师之家] 转长聘了 +7 简单化xn 2026-04-13 7/350 2026-04-14 14:50 by xindong
[考研] 302求调剂 +10 易!? 2026-04-13 10/500 2026-04-13 19:04 by lbsjt
信息提示
请填处理意见