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银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
silicare(金币+8, EPI+1): very good 2011-05-22 16:02:26
happy-j(金币+1): 2011-05-24 11:48:46
首先你要理解2^(-△△Ct 这个公式:
第一个△ 是目的基因减内参基因endogenous control.目的就是排除组内差异啦(内参的功能嘛)。
第二个△是第一个△的值减去对照组 reference sample.目的就是在比较时找一个标准(表达量是比它高呢还是低呢)
这个2就是默认扩展效率为1时,PCR每循环扩增的倍数了。
明白了上面的,你还要在软件设置:
1.replicates。就是重复次数啦,最少2次。
2.biological relicate groups .生物学重复次数。这个就是你实验重复次数。建议3次以上。

设置好以上(英文单词)选项,各种牌子的机子自带的软件就能帮你算出结果,并且绘制出表达差异柱状图。
PS. 你画的那个实验图。我理解实验组1,2,3,是3种不同处理。而对照1,2,3,也不相同。 这样会绘制3个柱状图。分别是每个处理组相对它对应的对照组的柱状图。
它的计算过程是:△△Ct=(CT实验组1-CT实验组1内参)-(CT对照组1-CT对照组1内参)。得到的是目的基因在实验组1条件下相对对照组1的表达量。比方说X基因在给药后A后提高了5倍表达。同理你2,3,实验的结论是:在给药B,C后表达调高几倍。

最后,再次强调,这是计算机会自己算的。你只要设置好这些。另外额外提示:△△Ct法要求引物扩展效率一致。要提前做这个预实验哦。
祝实验顺利。
3楼2011-05-21 22:52:02
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