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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Jfreda

铁虫 (小有名气)

[求助] gromacs中的一些问题

大家好,我有几个问题想向你们请教一下。
1.gromacs对体系升温的时候有必要对磷脂进行限制吗?蛋白和小分子分别进行了限制。
2.在NVT条件下升温的时候,tcoupl设为v-rescale,升温结束之后,在NTP条件下,放开限制性模拟,tcoupl是否可以设为Nose-Hoover,pcoupl是设为berendsen还是Parrinello-Rahman,然后接下去的NTP条件下无限制性平衡模拟和MD,这些参数是不是都不需要改了?谢谢!
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Jfreda

铁虫 (小有名气)

高手帮忙解答一下,谢谢!
2楼2011-04-28 20:10:49
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