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gromacs中的一些问题
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大家好，我有几个问题想向你们请教一下。 1.gromacs对体系升温的时候有必要对磷脂进行限制吗？蛋白和小分子分别进行了限制。 2.在NVT条件下升温的时候，tcoupl设为v-rescale,升温结束之后，在NTP条件下，放开限制性模拟，tcoupl是否可以设为Nose-Hoover，pcoupl是设为berendsen还是Parrinello-Rahman，然后接下去的NTP条件下无限制性平衡模拟和MD，这些参数是不是都不需要改了？谢谢！ |
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2楼2011-04-28 20:10:49