应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 怎么计算离解能？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
141/2返回列表12下一页
查看: 1522  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

shenailin

木虫 (正式写手)

[求助] 怎么计算离解能？

想要计算胞嘧啶AT碱基对质子化后的结构ATH+的离解能（dissociation energy)。用De=E(AT)-E(AH+)-E(T)对吗？如果对的话，需要求的三个能量都是优化得到的吗？
还是后面两个能量只需计算单点能？因为我在优化过程中AH+结构变化会很大（H+移到了另外的原子上），请高手指教？多谢您！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-04-28 08:32:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

奔鲨

铁虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shenailin(金币+1): 2011-04-28 14:11:18
小红豆(金币+2): 感谢交流！ 2011-04-29 11:17:49
BDE的论文那么多，随便看两篇就会了
赞一下(1人) 回复此楼
to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
2楼2011-04-28 09:37:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hexinchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shenailin(金币+5): 2011-04-28 14:11:50
小红豆(金币+2): 感谢交流！ 2011-04-29 11:17:55
简单的相加相减 然后具体的优化可以用一部分固定 来得到相应的能量
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-04-28 11:29:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shenailin

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hexinchem at 2011-04-28 11:29:11:
简单的相加相减 然后具体的优化可以用一部分固定 来得到相应的能量

意识是说用De=E(ATH+)-E(AH+)-E(T)这个公式计算是对的吗？
计算E(ATH+)和E(T)的时候必须是优化，而不能是计算单点能对吗？
优化过程中要是结构形变大的话就用固定一部分键长命令优化对吗？
请指教？
赞一下 回复此楼
4楼2011-04-28 14:16:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shenailin

木虫 (正式写手)
问题太简单了吗？没人回答我啊？那位高手指点一下吧！
赞一下 回复此楼
5楼2011-04-28 14:39:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

奔鲨

铁虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
shenailin(金币+1): 2011-04-28 15:21:59
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-04-29 11:03:18
小红豆(金币+2): 感谢交流！ 2011-04-29 11:18:07
引用回帖:
Originally posted by shenailin at 2011-04-28 14:16:01:
意识是说用De=E(ATH+)-E(AH+)-E(T)这个公式计算是对的吗？
计算E(ATH+)和E(T)的时候必须是优化，而不能是计算单点能对吗？
优化过程中要是结构形变大的话就用固定一部分键长命令优化对吗？
请指教？

如果你的分子大，建议用合理的方法和基组，先用小的预优化，再用大的，
如果涉及氢键，建议多用几种比较
键解离能和键解离焓差不多，具体你看看硕博论文，很有启发的
赞一下(2人) 回复此楼
to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
6楼2011-04-28 14:40:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shenailin

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 奔鲨 at 2011-04-28 14:40:00:
如果你的分子大，建议用合理的方法和基组，先用小的预优化，再用大的，
如果涉及氢键，建议多用几种比较
键解离能和键解离焓差不多，具体你看看硕博论文，很有启发的

我的整个体系都用同样的方法计算完了，到离解能分析这，一优化单个结构就发生形变。楼主越说我越迷惑了！
赞一下 回复此楼
7楼2011-04-28 15:26:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

奔鲨

铁虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
shenailin(金币+3): 2011-04-28 17:19:08
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-04-29 11:03:43
小红豆(金币+2): 感谢交流！ 2011-04-29 11:18:17
引用回帖:
Originally posted by shenailin at 2011-04-28 15:26:12:
我的整个体系都用同样的方法计算完了，到离解能分析这，一优化单个结构就发生形变。楼主越说我越迷惑了！

形变很正常啊，分子变成自由基，几何结构是要发生变化的
比如甲烷变成CH3，就变成平面了
理解能就是焓变的差值
赞一下(3人) 回复此楼
to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
8楼2011-04-28 15:31:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hexinchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shenailin(金币+3): 2011-04-28 17:15:15
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-04-29 11:03:58
引用回帖:
Originally posted by shenailin at 2011-04-28 14:16:01:
意识是说用De=E(ATH+)-E(AH+)-E(T)这个公式计算是对的吗？
计算E(ATH+)和E(T)的时候必须是优化，而不能是计算单点能对吗？
优化过程中要是结构形变大的话就用固定一部分键长命令优化对吗？
请指教？

楼上正解，是要优化，几个部分和总体都要优化，同时，计算焓变的差值
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2011-04-28 16:32:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shenailin

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hexinchem at 2011-04-28 16:32:50:
楼上正解，是要优化，几个部分和总体都要优化，同时，计算焓变的差值

那对于结构变化问题，必须要固定一些键吗？这样计算出来的能量可靠吗？焓变的差值怎样计算，能说详细一些吗？不好意思刚刚开始做这方面的东西，很无知！每次都是把输出文件中的HF能量提出来进行分析加减。
赞一下 回复此楼
10楼2011-04-28 17:18:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shenailin 的主题更新
141/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿北京理工大学本科211材料工程294求调剂 +8 mikasa的围巾 2026-03-28 8/400 2026-03-29 12:48 by 无际的草原
[考研] 求调剂，一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +7 @taotao 2026-03-29 7/350 2026-03-29 12:03 by longlotian
[考研] 一志愿北化求调剂 +4 Jsman 2026-03-22 4/200 2026-03-29 10:50 by 唐沐儿
[考研] 070300化学354求调剂 +5 101次希望 2026-03-28 5/250 2026-03-29 10:36 by 唐沐儿
[考研] 356求调剂 +4 gysy?s?a 2026-03-28 4/200 2026-03-29 10:32 by 唐沐儿
[考研] 0703化学 +11 妮妮ninicgb 2026-03-27 11/550 2026-03-29 06:45 by 544594351
[考研] 一志愿211 初试270分 求调剂 +8 谷雨上岸 2026-03-23 9/450 2026-03-29 01:00 by 我是小康
[考研] 085701求调剂初试286分 +4 secret0328 2026-03-28 4/200 2026-03-28 21:09 by 15366876211
[考研] 286求调剂 +12 PolarBear11 2026-03-26 12/600 2026-03-28 12:14 by zllcz
[考研] 张芳铭-中国农业大学-环境工程专硕-298 +4 手机用户 2026-03-26 4/200 2026-03-28 07:17 by mmm just
[考研] 一志愿211院校 344分 东北农业大学生物学学硕，求调剂 +5 丶风雪夜归人丶 2026-03-26 8/400 2026-03-27 19:22 by 丶风雪夜归人丶
[考研] 考研调剂 +4 Sanmu-124 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:49 by kiokin
[考研] 求调剂323材料与化工 +7 1124361 2026-03-24 7/350 2026-03-27 10:22 by wangjy2002
[考研] 材料调剂 5+4 想要一壶桃花水 2026-03-25 10/500 2026-03-26 19:56 by 不吃魚的貓
[考研] 打过很多竞赛，085406控制工程300分，求调剂 +3 askeladz 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:08 by 给你你注意休息
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分，求调剂 +6 jiajunX 2026-03-22 6/300 2026-03-25 23:05 by licg0208
[考研] 07化学303求调剂 +5 睿08 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:46 by 418490947
[考研] 材料与化工328分调剂 +6 。，。，。，。i 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:30 by 418490947
[考研] 277分求调剂，跨调材料 +3 考研调剂lxh 2026-03-24 3/150 2026-03-24 13:52 by JourneyLucky
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭