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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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shenailin

木虫 (正式写手)

[求助] 怎么计算离解能?

想要计算胞嘧啶AT碱基对质子化后的结构ATH+的离解能(dissociation energy)。用De=E(AT)-E(AH+)-E(T)对吗?如果对的话,需要求的三个能量都是优化得到的吗?
还是后面两个能量只需计算单点能?因为我在优化过程中AH+结构变化会很大(H+移到了另外的原子上),请高手指教?多谢您!
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hexinchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shenailin(金币+5): 2011-04-28 14:11:50
小红豆(金币+2): 感谢交流! 2011-04-29 11:17:55
简单的相加相减 然后具体的优化可以用一部分固定 来得到相应的能量
3楼2011-04-28 11:29:11
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奔鲨

铁虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shenailin(金币+1): 2011-04-28 14:11:18
小红豆(金币+2): 感谢交流! 2011-04-29 11:17:49
BDE的论文那么多,随便看两篇就会了
to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
2楼2011-04-28 09:37:18
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shenailin

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by hexinchem at 2011-04-28 11:29:11:
简单的相加相减 然后具体的优化可以用一部分固定 来得到相应的能量

意识是说用De=E(ATH+)-E(AH+)-E(T)这个公式计算是对的吗?
计算E(ATH+)和E(T)的时候必须是优化,而不能是计算单点能对吗?
优化过程中要是结构形变大的话就用固定一部分键长命令优化对吗?
请指教?
4楼2011-04-28 14:16:01
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shenailin

木虫 (正式写手)

问题太简单了吗?没人回答我啊?那位高手指点一下吧!
5楼2011-04-28 14:39:49
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