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shenailin

木虫 (正式写手)

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[求助] 怎么计算离解能？

想要计算胞嘧啶AT碱基对质子化后的结构ATH+的离解能（dissociation energy)。用De=E(AT)-E(AH+)-E(T)对吗？如果对的话，需要求的三个能量都是优化得到的吗？
还是后面两个能量只需计算单点能？因为我在优化过程中AH+结构变化会很大（H+移到了另外的原子上），请高手指教？多谢您！

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1楼 2011-04-28 08:32:31

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hexinchem

铁杆木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★
shenailin(金币+3): 2011-04-28 17:15:15
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-04-29 11:03:58

引用回帖:

Originally posted by shenailin at 2011-04-28 14:16:01:
意识是说用De=E(ATH+)-E(AH+)-E(T)这个公式计算是对的吗？
计算E(ATH+)和E(T)的时候必须是优化，而不能是计算单点能对吗？
优化过程中要是结构形变大的话就用固定一部分键长命令优化对吗？
请指教？

楼上正解，是要优化，几个部分和总体都要优化，同时，计算焓变的差值