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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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shenailin

木虫 (正式写手)

[求助] 怎么计算离解能？

想要计算胞嘧啶AT碱基对质子化后的结构ATH+的离解能（dissociation energy)。用De=E(AT)-E(AH+)-E(T)对吗？如果对的话，需要求的三个能量都是优化得到的吗？
还是后面两个能量只需计算单点能？因为我在优化过程中AH+结构变化会很大（H+移到了另外的原子上），请高手指教？多谢您！
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1楼 2011-04-28 08:32:31
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奔鲨

铁虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
shenailin(金币+1): 2011-04-28 15:21:59
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-04-29 11:03:18
小红豆(金币+2): 感谢交流！ 2011-04-29 11:18:07
引用回帖:
Originally posted by shenailin at 2011-04-28 14:16:01:
意识是说用De=E(ATH+)-E(AH+)-E(T)这个公式计算是对的吗？
计算E(ATH+)和E(T)的时候必须是优化，而不能是计算单点能对吗？
优化过程中要是结构形变大的话就用固定一部分键长命令优化对吗？
请指教？

如果你的分子大，建议用合理的方法和基组，先用小的预优化，再用大的，
如果涉及氢键，建议多用几种比较
键解离能和键解离焓差不多，具体你看看硕博论文，很有启发的
赞一下(2人) 回复此楼
to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
6楼2011-04-28 14:40:00
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奔鲨

铁虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shenailin(金币+1): 2011-04-28 14:11:18
小红豆(金币+2): 感谢交流！ 2011-04-29 11:17:49
BDE的论文那么多，随便看两篇就会了
赞一下(1人) 回复此楼
to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
2楼2011-04-28 09:37:18
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hexinchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
shenailin(金币+5): 2011-04-28 14:11:50
小红豆(金币+2): 感谢交流！ 2011-04-29 11:17:55
简单的相加相减 然后具体的优化可以用一部分固定 来得到相应的能量
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-04-28 11:29:11
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shenailin

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hexinchem at 2011-04-28 11:29:11:
简单的相加相减 然后具体的优化可以用一部分固定 来得到相应的能量

意识是说用De=E(ATH+)-E(AH+)-E(T)这个公式计算是对的吗？
计算E(ATH+)和E(T)的时候必须是优化，而不能是计算单点能对吗？
优化过程中要是结构形变大的话就用固定一部分键长命令优化对吗？
请指教？
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4楼2011-04-28 14:16:01
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