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0419xuhao

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助】gromacs周期性边界条件问题

大家好,我看到文献上有不用周期性边界条件在gromacs中做动力学的,mdp文件我也按手册上的改了。
但我跑完gro文件中的原子怎么都没有坐标呢?全是这样的:
  385Cl     Cl  6529     nan     nan     nan     nan     nan     nan

“nan”是什么意思啊?
是我设置的问题,还是有什么别的需要注意的地方?请高手指教。
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changle

木虫 (小有名气)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
御剑江湖(金币+1): 谢谢 2011-04-18 12:57:42
引用回帖:
Originally posted by 0419xuhao at 2011-04-18 09:22:55:
这个你真懂?

呵呵,人家跟你开玩笑呢。数据溢出了。
4楼2011-04-18 12:50:16
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shengxiang

木虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
"nan"就是“难”的意思,说你这个很难实现!哈哈~~~
2楼2011-04-18 08:28:28
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0419xuhao

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by shengxiang at 2011-04-18 08:28:28:
"nan"就是“难”的意思,说你这个很难实现!哈哈~~~

这个你真懂?
3楼2011-04-18 09:22:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

0419xuhao

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by changle at 2011-04-18 12:50:16:
呵呵,人家跟你开玩笑呢。数据溢出了。

呵呵,我知道他在忽悠我,那是我同学。
请问你知道有什么好的解决办法吗?我用周期性边界条件跑不动,不用周期性体系崩溃~哎,最近很郁闷。
5楼2011-04-19 09:23:11
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