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【求助/交流】请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较？
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请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较？ 期待高人，先谢谢了 |
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+3): 鼓励交流 2011-04-19 14:09:25
pidou213(金币+2): 说的很详细 2011-04-20 00:35:22
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+3): 鼓励交流 2011-04-19 14:09:25
pidou213(金币+2): 说的很详细 2011-04-20 00:35:22
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你可以把需要比对的序列用fasta格式保存在记事本里，然后用clustalW/clustalX的多重比对选项，直接按它默认的算法算算，生成的.dnd格式拿到MAGA里面的phylogeny——display newick tree from file选项中打开。就成了进化树了。可以在里面调整成你想要的表示方法和顺序，另存为就好了。 还有就是用DNAMAN , 多重比对（画了多条线并横着排列的标志multiple alignment），点了之后，将fasta格式保存的文件打开，选择是DNA还是蛋白质，然后以默认程序运算，出现的界面中选output——tree——最后一个，就有树了。你可以以不同的方式调整，然后输出。 如果还不行，你可以去网上搜搜相关说明书，那里会有比较详细的步骤。 希望能帮到你哈！ |
6楼2011-04-19 10:41:17
2楼2011-04-15 10:17:51
3楼2011-04-16 22:55:03
4楼2011-04-18 18:01:50
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