| 查看: 3772 | 回复: 17 | |||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||
[交流]
【求助】Autodock分析请教
|
|||||
|
1我运行完Autodock后产生dlg文件，然后我用写字板打开，将氨基酸残基坐标全部取出，然后复制到UltraEdit，转换成PDB格式，最后用GaussView打开。发现底物从选取的氨基酸里跑出来了，并没有对接。请问这是出什么问题了？应该怎么办？ 2我找的体系是带有底物的酶，我把底物取出来，试试Autodock能否对接成功。应该可以正确对接的，残基是根据文章选取的，为何会出现这种情况，难道文章提供的活性中心残基有问题？谢谢 3另外，还要请教下，按照手册分析，但结果可以弄出图片，难道手册上的分析是用来查看的，去坐标还是在dlg去吧，dlg是最终结果吧？ 4另外还有一个重要的问题请教，看到PDB中有氨基酸分A,B,那么在ADT中输入氨基酸时，要添加AB类型吧，我试了不能添加。请指教 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子对接问题锦集 | 分子模拟 |
» 猜你喜欢
面上没中，邀请各位路过的虫友分析一下分数
已经有15人回复
-
博士去二本高校当辅导员，如何调整心态？
已经有10人回复
-
面上有专家说实验设备不是我们单位的
已经有6人回复
-
27细胞生物学申博
已经有5人回复
-
江苏省自然基金 什么时候出结果
已经有6人回复
-
广西大学-广州大学招聘博士后 欢迎广大优秀人才！！！
已经有11人回复
-
闲聊
已经有3人回复
-
两块石头
已经有10人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有15人回复
-
初秋的晨风
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- AUTODOCK中的flexible residues的问题
已经有8人回复
- AutoDock参数设置问题
已经有6人回复
- 用AutoDock作分子对接前的小分子能量最小化问题
已经有6人回复
- Autodock对接构象有问题，请教
已经有7人回复
- 【求助】请教Autodock结果分析
已经有8人回复
- 【讨论】弱弱的问一句，为什么ubuntu不适合做autodock的操作系统
已经有13人回复
- 【求助】AUTODOCK的一个问题
已经有6人回复
- 【求助】关于Autodock中Grid中的问题
已经有9人回复
- 【原创】AutoDock使用笔记总结－原创始发
已经有32人回复
9楼2011-04-12 12:36:40
2楼2011-04-11 08:20:19
3楼2011-04-11 08:25:12
4楼2011-04-11 08:27:32