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【求助】Autodock分析请教
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1我运行完Autodock后产生dlg文件，然后我用写字板打开，将氨基酸残基坐标全部取出，然后复制到UltraEdit，转换成PDB格式，最后用GaussView打开。发现底物从选取的氨基酸里跑出来了，并没有对接。请问这是出什么问题了？应该怎么办？ 2我找的体系是带有底物的酶，我把底物取出来，试试Autodock能否对接成功。应该可以正确对接的，残基是根据文章选取的，为何会出现这种情况，难道文章提供的活性中心残基有问题？谢谢 3另外，还要请教下，按照手册分析，但结果可以弄出图片，难道手册上的分析是用来查看的，去坐标还是在dlg去吧，dlg是最终结果吧？ 4另外还有一个重要的问题请教，看到PDB中有氨基酸分A,B,那么在ADT中输入氨基酸时，要添加AB类型吧，我试了不能添加。请指教 |
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