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【求助】Autodock分析请教
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1我运行完Autodock后产生dlg文件,然后我用写字板打开,将氨基酸残基坐标全部取出,然后复制到UltraEdit,转换成PDB格式,最后用GaussView打开。发现底物从选取的氨基酸里跑出来了,并没有对接。请问这是出什么问题了?应该怎么办? 2我找的体系是带有底物的酶,我把底物取出来,试试Autodock能否对接成功。应该可以正确对接的,残基是根据文章选取的,为何会出现这种情况,难道文章提供的活性中心残基有问题?谢谢 3另外,还要请教下,按照手册分析,但结果可以弄出图片,难道手册上的分析是用来查看的,去坐标还是在dlg去吧,dlg是最终结果吧? 4另外还有一个重要的问题请教,看到PDB中有氨基酸分A,B,那么在ADT中输入氨基酸时,要添加AB类型吧,我试了不能添加。请指教 |
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