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【求助】请教使用Ambertools处理ligand的问题
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kevinding
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【求助】请教使用Ambertools处理ligand的问题
各位高手,我在使用Chimera调用AmberTools里面的antechamber处理ligand 加力场的时候 报错了 不知道什么原因 在处理小分子的时候有什么需要注意的么?对小分子无助又什么要求吗?
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1楼
2011-04-03 23:05:12
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hhwinhuanghe
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ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-04-07 12:41:16
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Originally posted by
kevinding
at 2011-04-03 23:05:12:
各位高手,我在使用Chimera调用AmberTools里面的antechamber处理ligand 加力场的时候 报错了 不知道什么原因 在处理小分子的时候有什么需要注意的么?对小分子无助又什么要求吗?
补充一下,有时候pdb格式没有mol2格式管用
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3楼
2011-04-05 00:23:59
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hhwinhuanghe
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kevinding(金币
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ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-04-07 12:41:04
引用回帖:
Originally posted by
kevinding
at 2011-04-03 23:05:12:
各位高手,我在使用Chimera调用AmberTools里面的antechamber处理ligand 加力场的时候 报错了 不知道什么原因 在处理小分子的时候有什么需要注意的么?对小分子无助又什么要求吗?
建议安装ambertool用命令行
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2楼
2011-04-05 00:23:01
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kevinding
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Originally posted by
hhwinhuanghe
at 2011-04-05 00:23:59:
补充一下,有时候pdb格式没有mol2格式管用
谢谢
你好 我是用命令行装的 我按照那个教程来处理例子上的配基可以的 但是处理我自己的配基就不行了 不知道什么原因
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4楼
2011-04-05 13:40:50
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fjeld
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kevinding(金币
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):谢谢参与
请问antechamber的错误信息是什么?
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5楼
2011-05-25 00:27:53
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