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kevinding

至尊木虫 (小有名气)


[交流] 【求助】请教使用Ambertools处理ligand的问题

各位高手,我在使用Chimera调用AmberTools里面的antechamber处理ligand 加力场的时候 报错了 不知道什么原因 在处理小分子的时候有什么需要注意的么?对小分子无助又什么要求吗?
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hhwinhuanghe

木虫 (小有名气)


★ ★
kevinding(金币+2):谢谢参与
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-04-07 12:41:04
引用回帖:
Originally posted by kevinding at 2011-04-03 23:05:12:
各位高手,我在使用Chimera调用AmberTools里面的antechamber处理ligand 加力场的时候 报错了 不知道什么原因 在处理小分子的时候有什么需要注意的么?对小分子无助又什么要求吗?

建议安装ambertool用命令行
2楼2011-04-05 00:23:01
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hhwinhuanghe

木虫 (小有名气)



ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-04-07 12:41:16
引用回帖:
Originally posted by kevinding at 2011-04-03 23:05:12:
各位高手,我在使用Chimera调用AmberTools里面的antechamber处理ligand 加力场的时候 报错了 不知道什么原因 在处理小分子的时候有什么需要注意的么?对小分子无助又什么要求吗?

补充一下,有时候pdb格式没有mol2格式管用
3楼2011-04-05 00:23:59
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