24小时热门版块排行榜    

查看: 1174  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zsl_321123

铁虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dmol优化 你可能没注意到的问题,讨论正在进行中......? 已有3人参与

看到群里面dmol适用者较多,而且好多人发站内信问我dmol的一些相关问题。
多数问题,我基本上还能应付,毕竟用dmol两年多了,也用它发了几篇文章。但是下面的问题,
我却不知道如何更好的解释,请大家共商量,征求高手的建议。

由于我做的是非周期性模型,优化的时候,一般是设置fine精度,而且优化的时候
通过频率来看我的model是否稳定。

但是最近有几个人问我优化晶体结构,勾选频率为什么老有虚频。

周期结构分为三类: 1.严格的a, b, c上都有周期性

                           2. 建表面,例如c方向上有真空层

                           3. 团簇,或自由小分子,放到一个大的box里面

这三个结构优化的时候,发现1和2基本上每次都有虚频,我认为第一和第二种情况优化的时候算虚频没多少道理,可是有个人的问题把我
难倒了,那为什么dmol在周期性表面吸附反应,搜索过渡态的时候,就算了频率呢,而且这个频率是一定要算的(为了验证过渡态搜索成功)。

不知道群里面大家是怎样看待这个问题的?

[ Last edited by zsl_321123 on 2011-4-1 at 09:40 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

宁愿骑着自行车笑,不愿坐着宝马哭。。。。。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

acridine

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流讨论 2011-04-01 16:33:55
这个频率计算完了可以看振动模式吧,通过这个来看这个虚频是与什么有关可以不?晶格有关就试着优化下晶格,原子有关就调整下原子...
不太懂~纯外行人士~路过
PS:不知道新版本dmol优化晶格的功能有没有好一些
4楼2011-04-01 16:13:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

lonewolf659

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3): 谢谢详细指点 2011-04-01 08:26:27
楼主的问题在5d6d也发了,我在那里回复了。现在copy到这里,不是为了骗分的哦。呵呵。版主不违规吧。

对于团簇模型,由于放在一个大盒子里,在不考虑体系和镜像的相互作用时,盒子的大小,即晶胞参数对体系没有影响。而且这种模型一般只取gamma点。此时的opt,完全可以看作是孤立体系的opt。因此,优化过程没有约束,体系一般能达到局域最稳定点。
但是对于周期型的块体和表面,除了在优化原胞时会选择优化晶胞参数,实际在计算中,我们一般用超胞建模,不优化晶胞参数的。这样的结果是体系在限制的晶胞参数下趋向局域最稳定,不能视为完全的优化。
而虚频的产生,意味着原子处在某个势能剖面的最高点,受力最大。因此虚频很可能是晶胞参数的限制造成的。不过这样的虚频应该不大,小于opt收敛设置的受力标准。
这是我个人的理解,等待高手指正。

[ Last edited by lonewolf659 on 2011-4-1 at 08:18 ]
差距,差距啊!
2楼2011-04-01 08:13:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zsl_321123

铁虫 (正式写手)

感谢lonewolf659,“实际在计算中,我们一般用超胞建模,不优化晶胞参数的。这样的结果是体系在限制的晶胞参数下趋向局域最稳定,不能视为完全的优化。”

那你在做这一步优化的时候还要选上频率计算吗?感觉没必要了。
宁愿骑着自行车笑,不愿坐着宝马哭。。。。。
3楼2011-04-01 09:35:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化工335求调剂 +4 摸摸猫猫头 2026-03-02 4/200 2026-03-02 22:57 by 向上的胖东
[考研] 0856材料与化工,270求调剂 +11 YXCT 2026-03-01 13/650 2026-03-02 21:38 by sunny81
[考研] 276求调剂 +5 路lyh123 2026-02-28 6/300 2026-03-02 20:35 by hypershenger
[考研] 求调剂 +7 repeatt?t 2026-02-28 7/350 2026-03-02 20:34 by hypershenger
[考研] 302材料工程求调剂 +5 Doleres 2026-03-01 6/300 2026-03-02 19:53 by 张晓芳0105
[考研] 化工京区271求调剂 +6 11ing 2026-03-02 6/300 2026-03-02 18:52 by caszguilin
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 15/750 2026-03-02 18:47 by caszguilin
[考研] 290求调剂 +6 ErMiao1020 2026-03-02 6/300 2026-03-02 18:14 by lature00
[考研] 一志愿华南理工大学材料与化工326分,求调剂 +3 wujinrui1 2026-02-28 3/150 2026-03-02 16:36 by chuocheng
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +6 礼堂丁真258 2026-02-28 9/450 2026-03-02 12:04 by 52hz~~
[考研] 295求调剂 +8 19171856320 2026-02-28 8/400 2026-03-02 11:19 by yuchj
[考研] 材料学硕318求调剂 +14 February_Feb 2026-03-01 16/800 2026-03-02 11:17 by yuchj
[基金申请] 此成果不能导入原因:元数据必填信息不完整,可 进行补充。 +4 Kittylucky 2026-03-02 5/250 2026-03-02 11:07 by jurkat.1640
[考研] 一志愿郑大材料学硕298分,求调剂 +6 wsl111 2026-03-01 6/300 2026-03-02 11:00 by ydudjddnd
[考研] 化工专硕342,一志愿大连理工大学,求调剂 +6 kyf化工 2026-02-28 7/350 2026-03-02 10:56 by 无际的草原
[考研] 材料学调剂 +10 提神豆沙包 2026-02-28 12/600 2026-03-02 09:26 by 李老师!
[基金申请] 成果系统访问量大,请一小时后再尝试。---NSFC啥时候好哦,已经两天这样了 +4 NSFC2026我来了 2026-02-28 4/200 2026-03-01 22:37 by 铁门栓
[考研] 299求调剂 +3 Y墨明棋妙Y 2026-02-28 5/250 2026-03-01 21:01 by tangxiaotian
[考研] 311求调剂 +6 亭亭亭01 2026-03-01 6/300 2026-03-01 15:41 by 324616
[考研] 295复试调剂 +3 简木ChuFront 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:27 by zzxw520th
信息提示
请填处理意见