| 查看: 1191 | 回复: 3 | |||
[交流]
【求助】dmol优化 你可能没注意到的问题，讨论正在进行中......? 已有3人参与
|
|
看到群里面dmol适用者较多，而且好多人发站内信问我dmol的一些相关问题。 多数问题，我基本上还能应付，毕竟用dmol两年多了，也用它发了几篇文章。但是下面的问题， 我却不知道如何更好的解释，请大家共商量，征求高手的建议。 由于我做的是非周期性模型，优化的时候，一般是设置fine精度，而且优化的时候 通过频率来看我的model是否稳定。 但是最近有几个人问我优化晶体结构，勾选频率为什么老有虚频。 周期结构分为三类： 1.严格的a, b, c上都有周期性 2. 建表面，例如c方向上有真空层 3. 团簇，或自由小分子，放到一个大的box里面 这三个结构优化的时候，发现1和2基本上每次都有虚频，我认为第一和第二种情况优化的时候算虚频没多少道理，可是有个人的问题把我 难倒了，那为什么dmol在周期性表面吸附反应，搜索过渡态的时候，就算了频率呢，而且这个频率是一定要算的（为了验证过渡态搜索成功）。 不知道群里面大家是怎样看待这个问题的？ [ Last edited by zsl_321123 on 2011-4-1 at 09:40 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
化学工程085602 305分求调剂
已经有10人回复
-
289求调剂
已经有15人回复
-
291 求调剂
已经有7人回复
-
274求调剂
已经有14人回复
-
北京林业大学硕导招生广告
已经有3人回复
-
309求调剂
已经有5人回复
-
292求调剂
已经有8人回复
-
求调剂
已经有4人回复
-
一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂
已经有3人回复
-
调剂310
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 用Dmol计算Fe吸附石墨烯优化时自旋问题
已经有5人回复
- 怎样在DMol3 结构优化中使构型基本保持不变？
已经有7人回复
- dmol在对晶胞参数进行优化时是否应该固定晶胞角度（fix angles）
已经有12人回复
- dmol优化频率问题
已经有5人回复
- 请教有关DMOL3的设置问题
已经有10人回复
- 【求助】用Dmol3优化羟自由基输出文件中找somo
已经有7人回复
- 【求助】关于dmol中部分原子固定的几何优化问题
已经有10人回复
- 【求助】DMol3过渡态搜索的相关问题
已经有6人回复
- 【求助】DMol3优化参数的选择
已经有17人回复
lonewolf659
铜虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 1865.3
- 红花: 1
- 帖子: 145
- 在线: 158.2小时
- 虫号: 482744
- 注册: 2007-12-26
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3): 谢谢详细指点 2011-04-01 08:26:27
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3): 谢谢详细指点 2011-04-01 08:26:27
|
楼主的问题在5d6d也发了，我在那里回复了。现在copy到这里，不是为了骗分的哦。呵呵。版主不违规吧。 对于团簇模型，由于放在一个大盒子里，在不考虑体系和镜像的相互作用时，盒子的大小，即晶胞参数对体系没有影响。而且这种模型一般只取gamma点。此时的opt，完全可以看作是孤立体系的opt。因此，优化过程没有约束，体系一般能达到局域最稳定点。 但是对于周期型的块体和表面，除了在优化原胞时会选择优化晶胞参数，实际在计算中，我们一般用超胞建模，不优化晶胞参数的。这样的结果是体系在限制的晶胞参数下趋向局域最稳定，不能视为完全的优化。 而虚频的产生，意味着原子处在某个势能剖面的最高点,受力最大。因此虚频很可能是晶胞参数的限制造成的。不过这样的虚频应该不大，小于opt收敛设置的受力标准。 这是我个人的理解，等待高手指正。 [ Last edited by lonewolf659 on 2011-4-1 at 08:18 ] |
2楼2011-04-01 08:13:50
3楼2011-04-01 09:35:08
acridine
木虫 (正式写手)
- 1ST强帖: 11
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 4901.6
- 红花: 13
- 帖子: 706
- 在线: 389.5小时
- 虫号: 305478
- 注册: 2006-12-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
4楼2011-04-01 16:13:01
