| 查看: 1086 | 回复: 3 | |||
[交流]
【求助】dmol优化 你可能没注意到的问题,讨论正在进行中......?已有3人参与
|
|
看到群里面dmol适用者较多,而且好多人发站内信问我dmol的一些相关问题。 多数问题,我基本上还能应付,毕竟用dmol两年多了,也用它发了几篇文章。但是下面的问题, 我却不知道如何更好的解释,请大家共商量,征求高手的建议。 由于我做的是非周期性模型,优化的时候,一般是设置fine精度,而且优化的时候 通过频率来看我的model是否稳定。 但是最近有几个人问我优化晶体结构,勾选频率为什么老有虚频。 周期结构分为三类: 1.严格的a, b, c上都有周期性 2. 建表面,例如c方向上有真空层 3. 团簇,或自由小分子,放到一个大的box里面 这三个结构优化的时候,发现1和2基本上每次都有虚频,我认为第一和第二种情况优化的时候算虚频没多少道理,可是有个人的问题把我 难倒了,那为什么dmol在周期性表面吸附反应,搜索过渡态的时候,就算了频率呢,而且这个频率是一定要算的(为了验证过渡态搜索成功)。 不知道群里面大家是怎样看待这个问题的? [ Last edited by zsl_321123 on 2011-4-1 at 09:40 ] |
» 猜你喜欢
寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件
已经有7人回复
到新单位后,换了新的研究方向,没有团队,持续积累2区以上论文,能申请到面上吗
已经有8人回复
申请2026年博士
已经有6人回复
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有5人回复
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有5人回复
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有7人回复
请问有评职称,把科研教学业绩算分排序的高校吗
已经有6人回复
Bioresource Technology期刊,第一次返修的时候被退回好几次了
已经有7人回复
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢
已经有5人回复
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
用Dmol计算Fe吸附石墨烯优化时自旋问题
已经有5人回复
怎样在DMol3 结构优化中使构型基本保持不变?
已经有7人回复
dmol在对晶胞参数进行优化时是否应该固定晶胞角度(fix angles)
已经有12人回复
dmol优化频率问题
已经有5人回复
请教有关DMOL3的设置问题
已经有10人回复
【求助】用Dmol3优化羟自由基输出文件中找somo
已经有7人回复
【求助】关于dmol中部分原子固定的几何优化问题
已经有10人回复
【求助】DMol3过渡态搜索的相关问题
已经有6人回复
【求助】DMol3优化参数的选择
已经有17人回复

lonewolf659
铜虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 1865.3
- 红花: 1
- 帖子: 145
- 在线: 158.2小时
- 虫号: 482744
- 注册: 2007-12-26
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3): 谢谢详细指点 2011-04-01 08:26:27
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+3): 谢谢详细指点 2011-04-01 08:26:27
|
楼主的问题在5d6d也发了,我在那里回复了。现在copy到这里,不是为了骗分的哦。呵呵。版主不违规吧。 对于团簇模型,由于放在一个大盒子里,在不考虑体系和镜像的相互作用时,盒子的大小,即晶胞参数对体系没有影响。而且这种模型一般只取gamma点。此时的opt,完全可以看作是孤立体系的opt。因此,优化过程没有约束,体系一般能达到局域最稳定点。 但是对于周期型的块体和表面,除了在优化原胞时会选择优化晶胞参数,实际在计算中,我们一般用超胞建模,不优化晶胞参数的。这样的结果是体系在限制的晶胞参数下趋向局域最稳定,不能视为完全的优化。 而虚频的产生,意味着原子处在某个势能剖面的最高点,受力最大。因此虚频很可能是晶胞参数的限制造成的。不过这样的虚频应该不大,小于opt收敛设置的受力标准。 这是我个人的理解,等待高手指正。 [ Last edited by lonewolf659 on 2011-4-1 at 08:18 ] |

2楼2011-04-01 08:13:50

3楼2011-04-01 09:35:08
acridine
木虫 (正式写手)
- 1ST强帖: 11
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 4901.6
- 红花: 13
- 帖子: 706
- 在线: 389.5小时
- 虫号: 305478
- 注册: 2006-12-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II :电子结构
4楼2011-04-01 16:13:01













回复此楼