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zsl_321123

铁虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dmol优化 你可能没注意到的问题,讨论正在进行中......? 已有3人参与

看到群里面dmol适用者较多,而且好多人发站内信问我dmol的一些相关问题。
多数问题,我基本上还能应付,毕竟用dmol两年多了,也用它发了几篇文章。但是下面的问题,
我却不知道如何更好的解释,请大家共商量,征求高手的建议。

由于我做的是非周期性模型,优化的时候,一般是设置fine精度,而且优化的时候
通过频率来看我的model是否稳定。

但是最近有几个人问我优化晶体结构,勾选频率为什么老有虚频。

周期结构分为三类: 1.严格的a, b, c上都有周期性

                           2. 建表面,例如c方向上有真空层

                           3. 团簇,或自由小分子,放到一个大的box里面

这三个结构优化的时候,发现1和2基本上每次都有虚频,我认为第一和第二种情况优化的时候算虚频没多少道理,可是有个人的问题把我
难倒了,那为什么dmol在周期性表面吸附反应,搜索过渡态的时候,就算了频率呢,而且这个频率是一定要算的(为了验证过渡态搜索成功)。

不知道群里面大家是怎样看待这个问题的?

[ Last edited by zsl_321123 on 2011-4-1 at 09:40 ]
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lonewolf659

铜虫 (小有名气)

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zzy870720z(金币+3): 谢谢详细指点 2011-04-01 08:26:27
楼主的问题在5d6d也发了,我在那里回复了。现在copy到这里,不是为了骗分的哦。呵呵。版主不违规吧。

对于团簇模型,由于放在一个大盒子里,在不考虑体系和镜像的相互作用时,盒子的大小,即晶胞参数对体系没有影响。而且这种模型一般只取gamma点。此时的opt,完全可以看作是孤立体系的opt。因此,优化过程没有约束,体系一般能达到局域最稳定点。
但是对于周期型的块体和表面,除了在优化原胞时会选择优化晶胞参数,实际在计算中,我们一般用超胞建模,不优化晶胞参数的。这样的结果是体系在限制的晶胞参数下趋向局域最稳定,不能视为完全的优化。
而虚频的产生,意味着原子处在某个势能剖面的最高点,受力最大。因此虚频很可能是晶胞参数的限制造成的。不过这样的虚频应该不大,小于opt收敛设置的受力标准。
这是我个人的理解,等待高手指正。

[ Last edited by lonewolf659 on 2011-4-1 at 08:18 ]
差距,差距啊!
2楼2011-04-01 08:13:50
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zsl_321123

铁虫 (正式写手)

感谢lonewolf659,“实际在计算中,我们一般用超胞建模,不优化晶胞参数的。这样的结果是体系在限制的晶胞参数下趋向局域最稳定,不能视为完全的优化。”

那你在做这一步优化的时候还要选上频率计算吗?感觉没必要了。
宁愿骑着自行车笑,不愿坐着宝马哭。。。。。
3楼2011-04-01 09:35:08
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acridine

木虫 (正式写手)

★ ★
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zzy870720z(金币+1): 鼓励交流讨论 2011-04-01 16:33:55
这个频率计算完了可以看振动模式吧,通过这个来看这个虚频是与什么有关可以不?晶格有关就试着优化下晶格,原子有关就调整下原子...
不太懂~纯外行人士~路过
PS:不知道新版本dmol优化晶格的功能有没有好一些
4楼2011-04-01 16:13:01
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