应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】双链蛋白和小分子对接后呢，能做MD模拟吗？
51/1返回列表
查看: 765  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

bbslover

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】双链蛋白和小分子对接后呢，能做MD模拟吗？ 已有3人参与

以前把对接后的蛋白和配体进行md模拟，都可以很好的完成，当然，这里的蛋白是单链的，

现在我有双链蛋白（A B 链）和小分子配体进行了对接，接下来，我想对这个双链蛋白和小分子的对接复合体进行md模拟，可以吗？ 还是蛋白只能用一个链？

谢谢，新手多谢帮忙！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-03-25 08:50:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bbslover

金虫 (正式写手)
好的，这两条链都有作用，我要用双链了！
赞一下 回复此楼
4楼2011-03-26 21:20:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

ferlich

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-27 09:15:12
本帖内容被屏蔽
2楼2011-03-25 16:13:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xd200620940

铜虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-03-27 09:15:23
楼上正解。
单链\双链均可以MD，不存在技术问题
问题是你的研究目的是什么

比如：
      小分子结合后，双链相互作用的变化，则必须用双链
      再者研究结合前后蛋白的构象变化，若双链彼此不同，用双链
      相同的话，就如楼上所述
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-03-25 23:36:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭