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jack6335

铁杆木虫 (正式写手)


[交流] 【求助/交流】实时定量内参无条带!

我最近两次提取RNA反转录后做实时定量,用actin做内参,可是actin老是没带或不特异,而我的目的基因扩增曲线和溶解曲线都很好,重新合成引物还是不行,不知为何,改为GADPH做内参也是没带,以前用同一个引物做的挺好的啊,没想到居然在内参上出了问题,求高人解读
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银虫 (小有名气)


jack6335(金币+1): 我又合成了还是不行,换成GADPH还是不行,真崩溃! 2011-03-23 12:13:06
我遇到和你一样的问题,在这问了老长时间没人答,后来又合成了一管actin才出,再不出重新提RNA在反转吧
5楼2011-03-23 10:14:13
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查看全部 8 个回答

yabxxh

木虫 (正式写手)


jack6335(金币+2): 3Q! 2011-03-23 09:19:30
既然以前能PCR出来,现在却做不出来,应该是模版的问题,最好能跑一下cDNA电泳,看是否是均一的smear,内参应该很好得到的,好运
2楼2011-03-23 09:15:08
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jack6335

铁杆木虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by yabxxh at 2011-03-23 09:15:08:
既然以前能PCR出来,现在却做不出来,应该是模版的问题,最好能跑一下cDNA电泳,看是否是均一的smear,内参应该很好得到的,好运

可是我的目的基因没问题啊!
3楼2011-03-23 09:19:14
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yabxxh

木虫 (正式写手)


jack6335(金币+1): 我用以前反转的模板和这次的模板对比了一下,以前的actin能有单一条带,这次没有,我自己都觉得是不是我人品太差了,但几个目的基因还都有单一条带,我嘞个去! 2011-03-23 12:16:04
引用回帖:
Originally posted by jack6335 at 2011-03-23 08:36:44:
我最近两次提取RNA反转录后做实时定量,用actin做内参,可是actin老是没带或不特异,而我的目的基因扩增曲线和溶解曲线都很好,重新合成引物还是不行,不知为何,改为GADPH做内参也是没带,以前用同一个引物做的挺 ...

请问你是直接进行荧光定量PCR的吗?如果是的话,建议
1.确定你的内参基因在组织中表达,表达丰度低的话不是很好扩增,当然也不太适合做内参
2.确定内参基因的引物和扩增的酶没有问题,不行的话可以直接引用别人的内参引物
3.先用普通PCR做一下,看是否能获得内参基因,如果普通pcr无法获得的话,调整一下参数
4.关键的我觉得还是引物和RNA的完整性,
顺便说一下,你这个很奇怪,我碰到的都是内参能扩增出来,目的基因扩增不出,你的正好相反,呵呵
好运
6楼2011-03-23 10:22:26
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