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【求助/交流】做实时定量PCR需要校正内参吗?
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xnbioinfor
铜虫
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[交流]
【求助/交流】做实时定量PCR需要校正内参吗?
实验室的同事做Real-time PCR 之前 都要先做半定量PCR,校正内参,只有内参条带亮度相差无几时才做实时定量, 校正内参有必要吗
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1楼
2011-03-22 23:16:48
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xnbioinfor
铜虫
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Originally posted by
poog502
at 2011-03-23 08:21:39:
首先没搞明白
既然你半定量就把内参校正好了,好做什么Real-time PCR,直接用半定量的结果就可以说明问题了。
显然,我的做法是首先半定量确定引物的特异性(单一条带,亮)
其次,根据提取RNA的浓度,大致保证 ...
样品的RNA浓度差异不影响吗
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2011-03-25 23:56:45
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poog502
木虫
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★
xnbioinfor(金币
+1
):谢谢参与
首先没搞明白
既然你半定量就把内参校正好了,好做什么Real-time PCR,直接用半定量的结果就可以说明问题了。
显然,我的做法是首先半定量确定引物的特异性(单一条带,亮)
其次,根据提取RNA的浓度,大致保证反转录后所有的样品浓度较为一致,也可以核酸测定仪准确确定浓度
第三,Real-time PCR后将样品减去内参的Ct值,内参本来就是消除误差的。
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2楼
2011-03-23 08:21:39
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西瓜
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xnbioinfor(金币
+1
):谢谢参与
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Originally posted by
xnbioinfor
at 2011-03-25 23:56:45:
样品的RNA浓度差异不影响吗
内参本来就是消除样品量差异的,起始RNA浓度高了,内参信号就强,反之亦然。校正内参没必要。
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4楼
2011-03-26 00:28:05
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suuny
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):谢谢参与
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Originally posted by
xnbioinfor
at 2011-03-25 23:56:45:
样品的RNA浓度差异不影响吗
这个是有影响的! 虽然有一定的容忍度。
尽量保证RT前所用的RNA量一致。
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5楼
2011-03-26 05:00:49
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