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【求助/交流】求助关于基因序列的变异分析用什么软件?
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mandy33
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[交流]
【求助/交流】求助关于基因序列的变异分析用什么软件?
请教大家一个问题?
有谁知道基因序列的功能性分析用什么软件分析吗?比如一段基因序列,要分析出它包括不包括CArGboxes,Y boxes or TATAbox 怎么分析?用什么软件?请高人指点一下啊?急啊,谢谢各位啦!
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2011-02-20 14:40:04
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mandy33
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xmy0523
这个具体怎么操作啊?我进了bowtie,然后点击哪块,输入序列啊?
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2011-02-22 14:49:52
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dhd997(金币+3): 很活跃,欢迎常来交流 2011-02-20 14:54:45
1949stone(金币+1): 鼓励交流 2011-02-20 14:55:57
1949stone(金币+1): 鼓励交流 2011-02-20 14:56:09
mandy33(金币+1): 2011-02-22 14:46:30
我觉得的用Bowtie就行吧,把你要的那几段序列写进去,一运行就出来了。
http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml
当然很多其他的程序也应该可以。
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2011-02-20 14:47:00
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1949stone(金币+1): 鼓励交流 2011-02-20 14:56:06
还有,可以上NCBI去检索一下,用blast或者genbank。
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2011-02-20 14:48:11
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xmy0523
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rainwander(金币+1): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-02-20 23:07:01
mandy33(金币+1): 2011-02-22 14:46:40
http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_sequence_alignment_software
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2011-02-20 14:56:57
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