应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 【求助/交流】求助关于基因序列的变异分析用什么软件？
51/1返回列表
查看: 900  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

mandy33

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】求助关于基因序列的变异分析用什么软件？

请教大家一个问题?
有谁知道基因序列的功能性分析用什么软件分析吗？比如一段基因序列，要分析出它包括不包括CArGboxes，Y boxes or TATAbox 怎么分析？用什么软件？请高人指点一下啊？急啊，谢谢各位啦！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-02-20 14:40:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmy0523

新虫 (小有名气)
★
1949stone(金币+1): 鼓励交流 2011-02-20 14:56:06

还有，可以上NCBI去检索一下，用blast或者genbank。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-02-20 14:48:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

xmy0523

新虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+3): 很活跃，欢迎常来交流 2011-02-20 14:54:45
1949stone(金币+1): 鼓励交流 2011-02-20 14:55:57
1949stone(金币+1): 鼓励交流 2011-02-20 14:56:09
mandy33(金币+1): 2011-02-22 14:46:30

我觉得的用Bowtie就行吧，把你要的那几段序列写进去，一运行就出来了。http://bowtie-bio.sourceforge.net/index.shtml  当然很多其他的程序也应该可以。
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2011-02-20 14:47:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmy0523

新虫 (小有名气)
★
rainwander(金币+1): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-02-20 23:07:01
mandy33(金币+1): 2011-02-22 14:46:40

http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_sequence_alignment_software
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-02-20 14:56:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mandy33

银虫 (初入文坛)

xmy0523


这个具体怎么操作啊？我进了bowtie，然后点击哪块,输入序列啊？
赞一下 回复此楼
5楼2011-02-22 14:49:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭