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wavingsea9911

木虫 (小有名气)


[交流] 【求助】MOE中作MD模拟,如何获得rmsd轨迹图

我使用MOE2008作蛋白模型的动力学优化,但只能得到能量变化曲线,请问哪位高手能有生成rmsd优化曲线的方法,谢谢!
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lin_lin_lin

新虫 (初入文坛)



wavingsea9911(金币+1): 谢谢参与
需要用脚本来计算!哈哈~我有你还需要吗?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2012-05-02 18:45:34
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普通回帖

clwlmxr4

铜虫 (小有名气)



wavingsea9911(金币+1):谢谢参与
沙发,祝LZ得到正解!
2楼2011-02-10 11:52:02
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)



wavingsea9911(金币+1):谢谢参与
rmsd优化曲线?你指的是产生一个表?
3楼2011-02-11 09:08:28
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克罗米虎

金虫 (小有名气)


★ ★
wavingsea9911(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-02-18 22:58:28
5楼2011-02-18 17:29:24
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wavingsea9911

木虫 (小有名气)


送鲜花一朵
引用回帖:
1608289楼: Originally posted by lin_lin_lin at 2012-05-02 18:45:34:
需要用脚本来计算!哈哈~我有你还需要吗?

还需要,请发我邮箱wavingsea2008@gmail.com,谢谢!
7楼2012-05-02 22:38:16
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娜娜sunny

新虫 (初入文坛)



wavingsea9911(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
引用回帖:
821824楼: Originally posted by wavingsea9911 at 2011-02-10 11:35:13
我使用MOE2008作蛋白模型的动力学优化,但只能得到能量变化曲线,请问哪位高手能有生成rmsd优化曲线的方法,谢谢!

你好,我用的也是MOE2008做蛋白质建模和对接,刚接触这个软件感觉比较悲催,眼前一片迷茫,对于分子对接更是茫然,希望给些意见及建议
8楼2012-09-07 11:39:00
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wavingsea9911

木虫 (小有名气)


引用回帖:
1619381楼: Originally posted by 娜娜sunny at 2012-09-07 11:39:00
你好,我用的也是MOE2008做蛋白质建模和对接,刚接触这个软件感觉比较悲催,眼前一片迷茫,对于分子对接更是茫然,希望给些意见及建议...

MOE在各类大型药物设计软件中,算是容易上手的,建模和对接也很简单,找个人带你一下基本就能上手,当然计算结果的准确性和精确性还是要靠自己慢慢摸索提高的。
9楼2012-09-08 08:55:33
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曾玲199

新虫 (初入文坛)



wavingsea9911(金币+1): 谢谢参与
楼主会了吗
可不可以教教我
12楼2018-05-17 15:48:41
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曾玲199

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
6楼: Originally posted by lin_lin_lin at 2012-05-02 18:45:34
需要用脚本来计算!哈哈~我有你还需要吗?

可以给我一份吗
13楼2018-06-09 14:46:27
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简单回复
KZ14254楼
2011-02-13 17:58   回复  
wavingsea9911(金币+1):谢谢参与
mailinator10楼
2012-09-08 16:15   回复  
wavingsea9911(金币+1): 谢谢参与
gcworm11楼
2012-09-08 18:14   回复  
wavingsea9911(金币+1): 谢谢参与
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