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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢
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xiao_2008

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢

[root@xiaojianhui xiaojianhui]# cd xiao/
[root@xiaojianhui xiao]# cd gromacs-4.5.3.tar.gz
bash: cd: gromacs-4.5.3.tar.gz: 不是目录
[root@xiaojianhui xiao]# cd gromacs-4.5.3
[root@xiaojianhui gromacs-4.5.3]# ./configure
checking build system type... i686-pc-linux-gnu
checking host system type... i686-pc-linux-gnu
checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c
checking whether build environment is sane... yes
checking for a thread-safe mkdir -p... /bin/mkdir -p
checking for gawk... gawk
checking whether make sets $(MAKE)... yes
checking how to create a ustar tar archive... gnutar
checking for cc... no
checking for icc... no
checking for xlc... no
checking for gcc... no
configure: error: in `/home/xiaojianhui/xiao/gromacs-4.5.3':
configure: error: no acceptable C compiler found in $PATH
See `config.log' for more details.
[root@xiaojianhui gromacs-4.5.3]# make
make: *** 没有指明目标并且找不到 makefile。 停止。
[root@xiaojianhui gromacs-4.5.3]#
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1楼 2011-01-20 15:43:04
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xiao_2008

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xiao_2008 at 2011-01-20 15:43:04:
[root@xiaojianhui xiaojianhui]# cd xiao/
[root@xiaojianhui xiao]# cd gromacs-4.5.3.tar.gz
bash: cd: gromacs-4.5.3.tar.gz: 不是目录
[root@xiaojianhui xiao]# cd gromacs-4.5.3
[root@xiaojianhui gr ...

我想想问问cc, icc xlc, gcc
是什么啊 是不是就装一个gcc就可以呢，
还有我这步[root@xiaojianhui xiao]# cd gromacs-4.5.3
对了吗 谢谢
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5楼2011-01-21 09:53:18
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qphll

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xiao_2008(金币+1):谢谢参与
xiao_2008(金币+10): 谢谢 2011-01-21 09:51:18
ghcacj(金币+10): 谢谢 2011-01-23 15:43:52
root@xiaojianhui xiaojianhui]# cd xiao/
[root@xiaojianhui xiao]# cd gromacs-4.5.3.tar.gz

#tar -zxvf gromacs-4.5.3.tar.gz

bash: cd: gromacs-4.5.3.tar.gz: 不是目录
[root@xiaojianhui xiao]# cd gromacs-4.5.3
[root@xiaojianhui gromacs-4.5.3]# ./configure

./configure ... 将编译器等等信息加上.

checking build system type... i686-pc-linux-gnu
checking host system type... i686-pc-linux-gnu
checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c
checking whether build environment is sane... yes
checking for a thread-safe mkdir -p... /bin/mkdir -p
checking for gawk... gawk
checking whether make sets $(MAKE)... yes
checking how to create a ustar tar archive... gnutar
checking for cc... no
checking for icc... no
checking for xlc... no
checking for gcc... no

你cc, icc xlc, gcc都没有.....
configure: error: in `/home/xiaojianhui/xiao/gromacs-4.5.3':
configure: error: no acceptable C compiler found in $PATH

提醒你了....


See `config.log' for more details.
[root@xiaojianhui gromacs-4.5.3]# make

configure都没有通过, make什么呢?

make: *** 没有指明目标并且找不到 makefile。 停止。
[root@xiaojianhui gromacs-4.5.3]#


请参阅
http://www.gromacs.org/Downloads ... s?highlight=install

Gromacs的安装非常方便, 但是不代表如果你什么功课都没有做就能成功编译.
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2楼2011-01-21 00:56:30
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ferlich

禁虫 (小有名气)
★ ★
xiao_2008(金币+1):谢谢参与
xiao_2008(金币+3): 谢谢 2011-01-21 11:49:28
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-01-23 15:44:07
本帖内容被屏蔽
6楼2011-01-21 10:53:15
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qphll

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
xiao_2008(金币+3): 谢谢 2011-01-21 11:49:37
ghcacj(金币+3): 谢谢 2011-01-23 15:44:26
引用回帖:
Originally posted by xiao_2008 at 2011-01-21 09:53:18:

   


我想想问问cc, icc xlc, gcc
是什么啊 是不是就装一个gcc就可以呢，
还有我这步[root@xiaojianhui xiao]# cd gromacs-4.5.3
对了吗 谢谢

嗯, 如果你的课题中,模拟占了一定的比重, 那么系统学习一下linux, 包括如何自己写程序, 如果编译, 还有一些常用的命令, 是很有必要掌握的. 如果这一关都觉得困难, 那么就算能跑起来gromacs, 后面的分析也是一个迈不过的坎.
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2011-01-21 11:31:47
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