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vallen

银虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】关于自由能MM-PBSA的计算

在轨迹中提取出结构，用MM-PBSA来计算体系自由能，溶剂部分用PBSA计算，那么原来结构中的水分子是不是要去掉？

在AMBER中有工具可以直接计算MM-PBSA吗？

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1楼 2011-01-05 16:49:19

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ferlich

禁虫 (小有名气)

★
ghcacj(金币+1):谢谢 2011-01-06 09:16:25

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2楼2011-01-05 17:29:25

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sinokang

至尊木虫 (职业作家)

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★ ★ ★
ghcacj(金币+3):谢谢 2011-01-06 09:16:32

可以的，这是教程http://ambermd.org/tutorials/advanced/tutorial3/

赞一下(1人)

3楼2011-01-05 20:50:13

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