应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【求助】CIF中怎么样产生氢键
51/1返回列表
查看: 1196  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

倚门回首

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】CIF中怎么样产生氢键

我解结构时在lst文件中有氢键，但是我的CIF中没有氢键的列表，发文章应该要这个数据吧。我想问问怎么样在CIF文件中产生氢键列表。谢谢各位虫友。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

测试

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-12-17 17:45:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

454106649

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
倚门回首(金币+3): 2010-12-18 20:23:51
引用回帖:
Originally posted by 倚门回首 at 2010-12-17 17:45:47:
我解结构时在lst文件中有氢键，但是我的CIF中没有氢键的列表，发文章应该要这个数据吧。我想问问怎么样在CIF文件中产生氢键列表。谢谢各位虫友。

你确定做氢键了吗？
    INS中加htab 精修，到lst文件中找到氢键表抄到INS中，格式是：
    htab  A1  A2
    （A1是给体，A2是受体，若有对称操作，则为：
    eqiv  $1   .......
    htab A1  A2_$1)
    还有就是你做xcif的时候是否选上氢键表？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-12-18 08:29:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
应该是在ins中加入 HTAB
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-12-18 00:46:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

倚门回首

金虫 (小有名气)
我在lst文件中

Hydrogen bonds with  H..A < r(A) + 2.000 Angstroms  and   110 deg.

D-H           d(D-H)   d(H..A)   
O4-H4B         0.840    1.975   150.13    2.736    O2 [ x, -y+1/2, z-1/2 ]
O4-H4B         0.840    3.118   132.66    3.739    Br1 [ x, -y+1/2, z-1/2 ]

O4-H4B2        0.885    2.510   166.70    3.378    Br1 [ -x+1, y+1/2, -z+1/2 ]

我在ins中加上了
htab O4 Br1
htab O4 O2_$1
eqiv $1 x -1/2-Y -1/2+Z
精修以后，在lst中有了
Specified hydrogen bonds (with esds except fixed and riding H)

  D-H          H...A        D...A        <(DHA)

** No suitable H-bond found for O4...Br1 = 3.190(4) A **
** No suitable H-bond found for O4...O2_$1 = 12.189(6) A **
这是怎么回事，
赞一下 回复此楼
4楼2010-12-18 20:22:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

454106649

木虫 (著名写手)
倚门回首(金币+2): 2010-12-19 08:55:51
引用回帖:
Originally posted by 倚门回首 at 2010-12-18 20:22:06:
我在lst文件中

Hydrogen bonds with  H..A < r(A) + 2.000 Angstroms  and   110 deg.

D-H           d(D-H)   d(H..A)   
O4-H4B         0.840    1.975   1 ...

写的格式对了吗？写操作码时候别写错了，而且不带中括号！你那个Br1怎么没带_$..呢！
感觉这些距离应该都还可以的！
赞一下 回复此楼
5楼2010-12-18 21:57:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0854复试调剂 276 +4 wmm9 2026-03-01 5/250 2026-03-02 06:41 by 汪！？！
[考研] 0857调剂 +4 一ll半 2026-02-28 5/250 2026-03-02 02:33 by 908055542
[考研] 292求调剂 +6 yhk_819 2026-02-28 6/300 2026-03-01 23:23 by 向上的胖东
[考研] 0856材料与化工，270求调剂 +6 YXCT 2026-03-01 6/300 2026-03-01 23:21 by 向上的胖东
[基金申请] 成果系统访问量大，请一小时后再尝试。---NSFC啥时候好哦，已经两天这样了 +4 NSFC2026我来了 2026-02-28 4/200 2026-03-01 22:37 by 铁门栓
[考研] 272求调剂 +6 田智友 2026-02-28 6/300 2026-03-01 21:40 by 公瑾逍遥
[考研] 0805总分292，求调剂 +7 幻想之殇 2026-03-01 7/350 2026-03-01 21:22 by 公瑾逍遥
[考研] 306分材料调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:48 by 无际的草原
[考研] 0856化工专硕求调剂 +12 董boxing 2026-03-01 12/600 2026-03-01 19:45 by 材子momo
[考研] 295求调剂 +7 19171856320 2026-02-28 7/350 2026-03-01 18:54 by 18137688336
[基金申请] 刚录用，没有期刊号，但是在线可看的论文可以放为代表作吗 10+3 arang1 2026-03-01 3/150 2026-03-01 16:43 by babero
[考研] 313求调剂 +3 水流年lc 2026-02-28 3/150 2026-03-01 16:01 by 新能源达人
[考研] 311求调剂 +6 亭亭亭01 2026-03-01 6/300 2026-03-01 15:41 by 324616
[考研] 307求调剂 +5 wyyyqx 2026-03-01 5/250 2026-03-01 15:21 by Fff-1
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 材料284求调剂，一志愿郑州大学英一数二专硕 +10 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:12 by yc258
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[论文投稿] Optics letters投稿被拒求助 30+3 luckyry 2026-02-26 4/200 2026-03-01 09:06 by babero
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 4/200 2026-02-28 19:45 by 路lyh123
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭