应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【求助】CIF中怎么样产生氢键
61/1返回列表
查看: 1202  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

倚门回首

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】CIF中怎么样产生氢键

我解结构时在lst文件中有氢键，但是我的CIF中没有氢键的列表，发文章应该要这个数据吧。我想问问怎么样在CIF文件中产生氢键列表。谢谢各位虫友。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

测试

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-12-17 17:45:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
应该是在ins中加入 HTAB
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-12-18 00:46:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

454106649

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
倚门回首(金币+3): 2010-12-18 20:23:51
引用回帖:
Originally posted by 倚门回首 at 2010-12-17 17:45:47:
我解结构时在lst文件中有氢键，但是我的CIF中没有氢键的列表，发文章应该要这个数据吧。我想问问怎么样在CIF文件中产生氢键列表。谢谢各位虫友。

你确定做氢键了吗？
    INS中加htab 精修，到lst文件中找到氢键表抄到INS中，格式是：
    htab  A1  A2
    （A1是给体，A2是受体，若有对称操作，则为：
    eqiv  $1   .......
    htab A1  A2_$1)
    还有就是你做xcif的时候是否选上氢键表？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-12-18 08:29:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

倚门回首

金虫 (小有名气)
我在lst文件中

Hydrogen bonds with  H..A < r(A) + 2.000 Angstroms  and   110 deg.

D-H           d(D-H)   d(H..A)   
O4-H4B         0.840    1.975   150.13    2.736    O2 [ x, -y+1/2, z-1/2 ]
O4-H4B         0.840    3.118   132.66    3.739    Br1 [ x, -y+1/2, z-1/2 ]

O4-H4B2        0.885    2.510   166.70    3.378    Br1 [ -x+1, y+1/2, -z+1/2 ]

我在ins中加上了
htab O4 Br1
htab O4 O2_$1
eqiv $1 x -1/2-Y -1/2+Z
精修以后，在lst中有了
Specified hydrogen bonds (with esds except fixed and riding H)

  D-H          H...A        D...A        <(DHA)

** No suitable H-bond found for O4...Br1 = 3.190(4) A **
** No suitable H-bond found for O4...O2_$1 = 12.189(6) A **
这是怎么回事，
赞一下 回复此楼
4楼2010-12-18 20:22:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

454106649

木虫 (著名写手)
倚门回首(金币+2): 2010-12-19 08:55:51
引用回帖:
Originally posted by 倚门回首 at 2010-12-18 20:22:06:
我在lst文件中

Hydrogen bonds with  H..A < r(A) + 2.000 Angstroms  and   110 deg.

D-H           d(D-H)   d(H..A)   
O4-H4B         0.840    1.975   1 ...

写的格式对了吗？写操作码时候别写错了，而且不带中括号！你那个Br1怎么没带_$..呢！
感觉这些距离应该都还可以的！
赞一下 回复此楼
5楼2010-12-18 21:57:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanghua3062

铁杆木虫 (小有名气)
★
倚门回首(金币+1):谢谢参与
倚门回首(金币+2): 2010-12-19 08:56:04
到ins文件中加入
eqiv $2 x, -y+1/2, z-1/2
eqiv $3 -x+1, y+1/2, -z+1/2
htab O4 Br1_$2
htab O4 Br1_$3
试一下。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-12-18 22:36:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 倚门回首 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-20 7/350 2026-03-21 19:05 by 15709483992
[考研] 0805 316求调剂 +3 大雪深藏 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:55 by 学员8dgXkO
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 268求调剂 +9 简单点0 2026-03-17 9/450 2026-03-21 15:37 by lature00
[考研] 265求调剂 +12 梁梁校校 2026-03-19 14/700 2026-03-21 13:38 by lature00
[考研] 22 350 本科985求调剂，求老登收留 +3 李轶男003 2026-03-20 3/150 2026-03-21 13:28 by 搏击518
[考研] 279分求调剂 一志愿211 +14 chaojifeixia 2026-03-19 15/750 2026-03-21 13:24 by zhukairuo
[考研] 265求调剂 +3 Jack?k?y 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:17 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华南师大 070300（化学）304分求调剂 +3 0703武芊慧雪304 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:48 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:46 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 材料专硕英一数二306 +7 z1z2z3879 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:48 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 北科281学硕材料求调剂 +5 tcxiaoxx 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:35 by laoshidan
[考研] 求调剂 +3 eation27 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:32 by JourneyLucky
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 材料专硕326求调剂 +6 墨煜姒莘 2026-03-15 7/350 2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭