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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】ACTIN基因如何寻找~~Actin-like基因是什么？？
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adslye

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】ACTIN基因如何寻找~~Actin-like基因是什么？？

最近要做荧光定量PCR，内参基因打算用Actin,没什么经验。
就去NCBI的Nucleotide 检索我的：catharanthus roseus （长春花）Actin.
结果，长春花的就只有2条Actin-like 基因。。

Actin-like 是actin相似序列？可以用做actin 引物设计的模板不？感觉不一定，要试。。。

这方面以前没做过，理论理解也不行。拜托各位了~~
内参也可以用管家基因，但这些怎么找？ 如我上面去NCBI？还是搜文献，看人家
文献中的引物？我倾向于自己设计。。。。

核心问题：怎么找一个研究不多的物种中恒定表达的基因序列？用来做荧光定量PCR的内参基因。

[ Last edited by adslye on 2010-12-28 at 15:03 ]
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1楼 2010-12-16 23:14:04
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wangy0908

金虫 (正式写手)
adslye(金币+2):很有意思~能详细点说明吗？ 2010-12-18 19:29:00
最好找那种特异性很好的，以及不能有基因重叠的区域。3 UTP区域或者5‘utp区域吧。以及你找找其它的miRNA来做的吧。ACT基因不是很理想的。
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6楼2010-12-18 00:44:39
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wangy0908

金虫 (正式写手)
★
dhd997(金币+1):谢谢交流 2010-12-17 08:46:43
adslye(金币+2):多谢~~ 2010-12-17 09:06:55
如果有报道相关的文章话，觉得还是可以参考下。如果没有报道的，就可以用这个类似的基因来设计引无试试，只是从我自己做了以后发觉，RT-PCR的引物不好设计的。因为经常设计的引物不适合要求。
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2楼2010-12-17 04:01:03
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adslye

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wangy0908 at 2010-12-17 04:01:03:
如果有报道相关的文章话，觉得还是可以参考下。如果没有报道的，就可以用这个类似的基因来设计引无试试，只是从我自己做了以后发觉，RT-PCR的引物不好设计的。因为经常设计的引物不适合要求。

很无奈的哦~~
不是应该在一些保守的区域设计引物~
有人知道如何找这些保守序列吗？我生物是半路出家的。。。基础不好~
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3楼2010-12-17 09:08:30
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david_njust

银虫 (小有名气)
负责任的告诉你，我也不知道 哈哈
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4楼2010-12-17 09:25:47
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