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adslye

银虫 (正式写手)


[交流] 【求助/交流】ACTIN基因如何寻找~~Actin-like基因是什么??

最近要做荧光定量PCR,内参基因打算用Actin,没什么经验
就去NCBI的Nucleotide 检索我的:catharanthus roseus (长春花)Actin.
结果,长春花的就只有2条Actin-like 基因。。

Actin-like 是actin相似序列?可以用做actin 引物设计的模板不?感觉不一定,要试。。。

这方面以前没做过,理论理解也不行。拜托各位了~~
内参也可以用管家基因,但这些怎么找? 如我上面去NCBI?还是搜文献,看人家
文献中的引物?我倾向于自己设计。。。。

核心问题:怎么找一个研究不多的物种中恒定表达的基因序列?用来做荧光定量PCR的内参基因。


[ Last edited by adslye on 2010-12-28 at 15:03 ]
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david_njust

银虫 (小有名气)


负责任的告诉你,我也不知道 哈哈
4楼2010-12-17 09:25:47
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wangy0908

金虫 (正式写手)



dhd997(金币+1):谢谢交流 2010-12-17 08:46:43
adslye(金币+2):多谢~~ 2010-12-17 09:06:55
如果有报道相关的文章话,觉得还是可以参考下。如果没有报道的,就可以用这个类似的基因来设计引无试试,只是从我自己做了以后发觉,RT-PCR的引物不好设计的。因为经常设计的引物不适合要求。
2楼2010-12-17 04:01:03
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adslye

银虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by wangy0908 at 2010-12-17 04:01:03:
如果有报道相关的文章话,觉得还是可以参考下。如果没有报道的,就可以用这个类似的基因来设计引无试试,只是从我自己做了以后发觉,RT-PCR的引物不好设计的。因为经常设计的引物不适合要求。

很无奈的哦~~
不是应该在一些保守的区域设计引物~
有人知道如何找这些保守序列吗?我生物是半路出家的。。。基础不好~
3楼2010-12-17 09:08:30
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adslye

银虫 (正式写手)


楼上回复好雷银。。。。
5楼2010-12-17 11:37:30
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