| 查看: 1853 | 回复: 13 | |||
[交流]
【求助】安装packmol的comfigure怎么指定编译器?
|
|||
|
f the script was not able to find a suitable compiler, then you can manually set the compiler by: ./configure /path/to/your/compiler/yourcompiler packmol网站上这么说,具体命令式?我的gfortran放在/usr/bin/gfortran |
» 猜你喜欢
博士延得我,科研能力直往上蹿
已经有7人回复
退学或坚持读
已经有27人回复
面上基金申报没有其他的参与者成吗
已经有5人回复
有70后还继续奋斗在职场上的吗?
已经有5人回复
遇见不省心的家人很难过
已经有22人回复
多组分精馏求助
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
【求助】安装最后license的时候出问题
已经有4人回复
【分享】[04-12]精挑细选绿色软件推荐下载[清清心整理]【已搜索无重复】
已经有2人回复
【求助】谁能帮我解决在linux下安装ms出现的问题啊
已经有8人回复
【求助】ms在win7下安装出现的问题,希望大家帮帮忙哦
已经有13人回复
【求助】MS5.5的license失效了
已经有16人回复
【求助】在Win 7 上安装Materials studio 出现下面错误怎么办
已经有3人回复
【求助】如何增加matlab的内存
已经有1人回复
【求助】linux/MS中Gateway安装出错
已经有10人回复
封贴【求助】Accelrys Materials Studio 4.4安装出现问题
已经有4人回复
【求助】Materials Studio 5.0 linux license安装出问题了
已经有3人回复
【求助】ms5.0 安装问题???
已经有1人回复
【求助】Materials-studio4.4安装问题
已经有1人回复
【求助】程序出错
已经有4人回复
【求助】linux 下安装 Materials Studio 到底是用root,还是普通用户
已经有2人回复
【求助】MS4.4linux安装license错误
已经有8人回复
【求助】MS测试时出错
已经有4人回复
【求助】MS4.4安装错误
已经有7人回复
【求助】linux下安装MS软件不成功
已经有9人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
诚招化工、有机、高分子等领域博士后及科研助理
+2/130
结构动力学与结构健康监测方向欧盟玛丽居里全奖博士招聘
+1/78
山东征女友,坐标济南
+1/68
中国科学院深圳先进技术研究院——招聘博士后
+3/43
西安交通大学前沿院/机械学院招收2026级硕博研究生!
+1/32
西交利物浦大学招收26年【全奖】博士生1名(空间智能沉浸式手术导航)
+1/31
科罗拉多大学 Congjun Yu 课题组招聘
+1/29
德国Karlsruhe Institute of Technology招收电化学储能及联合培养CSC博士
+1/13
南京医科大学国家级高层次青年人才团队招收博士研究生
+1/13
中科院深圳先进院-免疫治疗方向-招收1名博士生(26年9月入学)
+1/12
太原理工大学集成电路学院院长团队招收2026年博士研究生
+1/7
加氢裂化
+1/4
广东省智能院与澳门大学/澳门理工联培博士招生
+1/4
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
+1/3
华南理工大学宋波教授联合唐本忠院士招聘化学和材料方向博士后(长期有效)
+1/2
德国Karlsruhe Institute of Technology招收电化学储能及联合培养CSC博士等
+1/2
海南大学国家优青团队招聘“AI/大数据+材料”方向专任教师(事业编制)
+1/1
【博士后/科研助理招聘-北京理工大学-集成电路与电子学院-国家杰青团队】
+1/1
双一流联合团队招聘团队青年人才与博后
+1/1
上海理工大学“新能源材料”专业-赵斌教授招收申请考核制博士生【能源催化方向】
+1/1
2楼2010-12-11 00:49:09
★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
|
在你的path里面只要定义好了你的编译器, 就不需要担心这个了. 一般可以这样 (我的是bash, 以Intel Fortran): (1) # vi ~/.bash_profile 增加这两句: PATH=/users/qphll/simulation/intelfortran/bin:$PATH export PATH 保存后, 运行这句使得你的修改立刻生效: # . ~/.bash_profile (2) # ifort 尝试调用ifort, 这个命令让你知道是否可以anywhere直接调用 (3) # which ifort 这个命令让你double check 系统path里面的调用路径,是不是你想要的那个命令. |
3楼2010-12-11 02:19:41
4楼2010-12-11 09:33:19
5楼2010-12-11 10:26:47
6楼2010-12-11 19:54:56
7楼2010-12-18 12:41:37
8楼2010-12-18 16:05:05
10楼2010-12-30 23:29:17
11楼2010-12-31 00:06:55
12楼2010-12-31 17:34:02
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+3):没有啊,很好啊,你的算法思想很好。。。。 2010-12-31 23:52:45
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-04 17:20:15
zyj8119(金币+3):没有啊,很好啊,你的算法思想很好。。。。 2010-12-31 23:52:45
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-04 17:20:15
|
我是做液晶的,我简单说一下我的解决办法,比较笨,也算土法炼钢了 我的要求是,希望体系中所有液晶都有固定的取向,然后和另外一个组分(比如说球)混合。 我的办法是,自己生成一个充满取向一致的液晶的盒子,当然空间也是规则排列的。然后用packmol生成一盒子随机排列的球,数目为最终体系需要的数目,数目然后自己写个程序把这两组坐标读进去,然后做个距离判据,如果一个液晶和球相距小于阈值,就把该液晶删了,最终体系的数密度会比设定的偏差一点,这时候没办法只能调整调整模拟盒子的大小了。 关于packmol的fix选项,在我的印象里,一个inp里面fix的分子数不能超过10个还是20个,也就是说你希望体系里所有的分子的取向或者坐标都按照你的设置来排列的话,分子数不能超过一个数量。这时候可以采用这样的办法,分几步来,先把十几个固定的分子生成一个小的块,然后把小块当做一个分子,复制几块变成大块,最后摆成最终的构型。比如说生成一个两相体系,可以先分别生成其中一相构成的“块”,再把两块读入进去后看成两个大分子拼在一起。 这都是在只能用packmol的前提下想出的一些笨办法。见笑了。 |
13楼2010-12-31 23:51:32
14楼2010-12-31 23:52:21
简单回复
黄石罐9楼
2010-12-19 12:53
回复
zyj8119(金币+1):谢谢参与
顶一下。













回复此楼