| 查看: 1822 | 回复: 13 | |||
[交流]
【求助】安装packmol的comfigure怎么指定编译器?
|
|||
|
f the script was not able to find a suitable compiler, then you can manually set the compiler by: ./configure /path/to/your/compiler/yourcompiler packmol网站上这么说,具体命令式?我的gfortran放在/usr/bin/gfortran |
» 猜你喜欢
常年博士招收(双一流,工科)
已经有4人回复
推荐一本书
已经有10人回复
纳米粒子粒径的测量
已经有6人回复
国自然申请面上模板最新2026版出了吗?
已经有6人回复
溴的反应液脱色
已经有4人回复
参与限项
已经有5人回复
有没有人能给点建议
已经有5人回复
假如你的研究生提出不合理要求
已经有12人回复
萌生出自己或许不适合搞科研的想法,现在跑or等等看?
已经有4人回复
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
【求助】安装最后license的时候出问题
已经有4人回复
【分享】[04-12]精挑细选绿色软件推荐下载[清清心整理]【已搜索无重复】
已经有2人回复
【求助】谁能帮我解决在linux下安装ms出现的问题啊
已经有8人回复
【求助】ms在win7下安装出现的问题,希望大家帮帮忙哦
已经有13人回复
【求助】MS5.5的license失效了
已经有16人回复
【求助】在Win 7 上安装Materials studio 出现下面错误怎么办
已经有3人回复
【求助】如何增加matlab的内存
已经有1人回复
【求助】linux/MS中Gateway安装出错
已经有10人回复
封贴【求助】Accelrys Materials Studio 4.4安装出现问题
已经有4人回复
【求助】Materials Studio 5.0 linux license安装出问题了
已经有3人回复
【求助】ms5.0 安装问题???
已经有1人回复
【求助】Materials-studio4.4安装问题
已经有1人回复
【求助】程序出错
已经有4人回复
【求助】linux 下安装 Materials Studio 到底是用root,还是普通用户
已经有2人回复
【求助】MS4.4linux安装license错误
已经有8人回复
【求助】MS测试时出错
已经有4人回复
【求助】MS4.4安装错误
已经有7人回复
【求助】linux下安装MS软件不成功
已经有9人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
哈尔滨工业大学王东博课题组/中科院上海微系统所梁丽娟课题组招收2026年博士生1名
+1/93
原子层沉积(ALD)磁控溅射PECVD等微纳代工服务:18817872921
+1/82
成会明院士团队|钱希堂(国家青年人才)招博后啦!二维材料和固态电池
+1/80
上海交通大学任垭萌课题组招聘博士后
+1/75
深圳大学材料学院黄妍斐教授课题组诚招2026年秋季入学博士生
+1/74
湖南科技大学资安学院管青军教授2026年招收审核制博士生
+1/66
北京-89175-事业单位-诚征女友
+1/58
211双一流北京工业大学招计算机、AI、自动控制、电子信息等方向博士生(长期有效)
+1/47
香港科技大学显示与光电国家重点实验室招收量子点钙钛矿光电液晶显示方向博士生
+1/42
上海科技大学物质科学与技术学院|王平鸾课题组联合招聘博士后
+1/28
坐标济南,山东农科院招 有机合成 or 药物化学 联培硕士研究生
+1/20
电子科技大学「基础与前沿研究院」文明健老师课题组招收博士
+1/16
英国布里斯托大学诚招博士生和联合培养生 (近期多个博士奖学金)
+1/14
香港科技大学 招生 2026 Fall全奖博士 -- 机械/电子/材料/化学
+1/12
天津理工大学材料学院陈民芳课题组诚招2026年秋季入学博士生
+1/9
太原理工大学电工部招聘老师-偏电类专业的博士们快来看啊
+1/8
武汉双一流高校干细胞与肿瘤生物学团队招聘2026级申请考核制博士生
+1/6
南京林业大学国家工程中心李海涛教授课题组招收研究生
+1/5
中国科学院大学-杨晗课题组-诚聘-博士后、副研究员
+1/4
中国科学院大学-杨晗课题组-诚聘-博士后、副研究员
+1/3
2楼2010-12-11 00:49:09
★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
|
在你的path里面只要定义好了你的编译器, 就不需要担心这个了. 一般可以这样 (我的是bash, 以Intel Fortran): (1) # vi ~/.bash_profile 增加这两句: PATH=/users/qphll/simulation/intelfortran/bin:$PATH export PATH 保存后, 运行这句使得你的修改立刻生效: # . ~/.bash_profile (2) # ifort 尝试调用ifort, 这个命令让你知道是否可以anywhere直接调用 (3) # which ifort 这个命令让你double check 系统path里面的调用路径,是不是你想要的那个命令. |
3楼2010-12-11 02:19:41
4楼2010-12-11 09:33:19
5楼2010-12-11 10:26:47
6楼2010-12-11 19:54:56
7楼2010-12-18 12:41:37
8楼2010-12-18 16:05:05
10楼2010-12-30 23:29:17
11楼2010-12-31 00:06:55
12楼2010-12-31 17:34:02
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+3):没有啊,很好啊,你的算法思想很好。。。。 2010-12-31 23:52:45
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-04 17:20:15
zyj8119(金币+3):没有啊,很好啊,你的算法思想很好。。。。 2010-12-31 23:52:45
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-04 17:20:15
|
我是做液晶的,我简单说一下我的解决办法,比较笨,也算土法炼钢了 我的要求是,希望体系中所有液晶都有固定的取向,然后和另外一个组分(比如说球)混合。 我的办法是,自己生成一个充满取向一致的液晶的盒子,当然空间也是规则排列的。然后用packmol生成一盒子随机排列的球,数目为最终体系需要的数目,数目然后自己写个程序把这两组坐标读进去,然后做个距离判据,如果一个液晶和球相距小于阈值,就把该液晶删了,最终体系的数密度会比设定的偏差一点,这时候没办法只能调整调整模拟盒子的大小了。 关于packmol的fix选项,在我的印象里,一个inp里面fix的分子数不能超过10个还是20个,也就是说你希望体系里所有的分子的取向或者坐标都按照你的设置来排列的话,分子数不能超过一个数量。这时候可以采用这样的办法,分几步来,先把十几个固定的分子生成一个小的块,然后把小块当做一个分子,复制几块变成大块,最后摆成最终的构型。比如说生成一个两相体系,可以先分别生成其中一相构成的“块”,再把两块读入进去后看成两个大分子拼在一起。 这都是在只能用packmol的前提下想出的一些笨办法。见笑了。 |
13楼2010-12-31 23:51:32
14楼2010-12-31 23:52:21
简单回复
黄石罐9楼
2010-12-19 12:53
回复
zyj8119(金币+1):谢谢参与
顶一下。












回复此楼