| 查看: 2169 | 回复: 13 | |||
[交流]
【求助】安装packmol的comfigure怎么指定编译器?
|
|||
|
f the script was not able to find a suitable compiler, then you can manually set the compiler by: ./configure /path/to/your/compiler/yourcompiler packmol网站上这么说,具体命令式?我的gfortran放在/usr/bin/gfortran |
» 猜你喜欢
售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
听说今天filecode变了
已经有34人回复
基金中了
已经有6人回复
filecode
已经有14人回复
固定端突然变了,今天
已经有7人回复
filecode
已经有11人回复
大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑
已经有6人回复
一个有机合成实验室都需要哪些设备?
已经有12人回复
求各位大神看下
已经有33人回复
咨询面上基金
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
【求助】安装最后license的时候出问题
已经有4人回复
【分享】[04-12]精挑细选绿色软件推荐下载[清清心整理]【已搜索无重复】
已经有2人回复
【求助】谁能帮我解决在linux下安装ms出现的问题啊
已经有8人回复
【求助】ms在win7下安装出现的问题,希望大家帮帮忙哦
已经有13人回复
【求助】MS5.5的license失效了
已经有16人回复
【求助】在Win 7 上安装Materials studio 出现下面错误怎么办
已经有3人回复
【求助】如何增加matlab的内存
已经有1人回复
【求助】linux/MS中Gateway安装出错
已经有10人回复
封贴【求助】Accelrys Materials Studio 4.4安装出现问题
已经有4人回复
【求助】Materials Studio 5.0 linux license安装出问题了
已经有3人回复
【求助】ms5.0 安装问题???
已经有1人回复
【求助】Materials-studio4.4安装问题
已经有1人回复
【求助】程序出错
已经有4人回复
【求助】linux 下安装 Materials Studio 到底是用root,还是普通用户
已经有2人回复
【求助】MS4.4linux安装license错误
已经有8人回复
【求助】MS测试时出错
已经有4人回复
【求助】MS4.4安装错误
已经有7人回复
【求助】linux下安装MS软件不成功
已经有9人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
山东征女友,坐标济南
+1/163
1,3,2-Dioxaphospholane, 2-(2,2,2-trifluoroethoxy)-
+1/89
三(三甲基硅基)甘油醚(CAS:6787-10-6 )
+1/88
1-甲基-1,2-双(三甲基硅氧基)乙烷(CAS:17887-27-3)
+1/87
乙二醇二甲基环硅醚(CAS:57915-66-9)
+1/87
三(三甲基硅烷)磷酸酯(CAS:10497-05-9)
+1/85
香港城市大学郑星课题组诚聘博士后 (生态学、环境科学、植物学、大气科学背景)
+1/83
坐标重庆 诚征男友
+1/63
北京理工大学-集成电路与电子学院杰青团队-招博士后
+1/42
同济大学环境学院肖倩课题组2026年补充招收推免生
+1/31
上海交通大学诚聘有机化学方向博士生/科研助理
+1/29
北理工集成电路杰青团队 | 诚招科助理
+1/17
澳大利亚 Murdoch University 全奖博士招生(3个名额)地质化工冶金领域
+1/12
希望大家都高中!!
+1/7
有合作举办scopus会议的吗?
+1/6
北理工集成电路杰青团队 | 诚招科助理
+1/5
国家纳米科学中心段鹏飞课题组招收2027年入学博士研究生
+1/4
哈尔滨工业大学韩飞课题组招收3D微纳加工、微纳器件、纳米化学等方向博士研究生
+1/3
【香港城市大学】范战西教授课题组现招收博士生(全奖, 2027年秋季入学)
+1/2
从 IF 13.9 到 56.1:单细胞+空间转录组顶刊研究思路深度拆解
+1/1
2楼2010-12-11 00:49:09
★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
|
在你的path里面只要定义好了你的编译器, 就不需要担心这个了. 一般可以这样 (我的是bash, 以Intel Fortran): (1) # vi ~/.bash_profile 增加这两句: PATH=/users/qphll/simulation/intelfortran/bin:$PATH export PATH 保存后, 运行这句使得你的修改立刻生效: # . ~/.bash_profile (2) # ifort 尝试调用ifort, 这个命令让你知道是否可以anywhere直接调用 (3) # which ifort 这个命令让你double check 系统path里面的调用路径,是不是你想要的那个命令. |
3楼2010-12-11 02:19:41
4楼2010-12-11 09:33:19
5楼2010-12-11 10:26:47
6楼2010-12-11 19:54:56
7楼2010-12-18 12:41:37
8楼2010-12-18 16:05:05
10楼2010-12-30 23:29:17
11楼2010-12-31 00:06:55
12楼2010-12-31 17:34:02
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+3):没有啊,很好啊,你的算法思想很好。。。。 2010-12-31 23:52:45
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-04 17:20:15
zyj8119(金币+3):没有啊,很好啊,你的算法思想很好。。。。 2010-12-31 23:52:45
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-04 17:20:15
|
我是做液晶的,我简单说一下我的解决办法,比较笨,也算土法炼钢了 我的要求是,希望体系中所有液晶都有固定的取向,然后和另外一个组分(比如说球)混合。 我的办法是,自己生成一个充满取向一致的液晶的盒子,当然空间也是规则排列的。然后用packmol生成一盒子随机排列的球,数目为最终体系需要的数目,数目然后自己写个程序把这两组坐标读进去,然后做个距离判据,如果一个液晶和球相距小于阈值,就把该液晶删了,最终体系的数密度会比设定的偏差一点,这时候没办法只能调整调整模拟盒子的大小了。 关于packmol的fix选项,在我的印象里,一个inp里面fix的分子数不能超过10个还是20个,也就是说你希望体系里所有的分子的取向或者坐标都按照你的设置来排列的话,分子数不能超过一个数量。这时候可以采用这样的办法,分几步来,先把十几个固定的分子生成一个小的块,然后把小块当做一个分子,复制几块变成大块,最后摆成最终的构型。比如说生成一个两相体系,可以先分别生成其中一相构成的“块”,再把两块读入进去后看成两个大分子拼在一起。 这都是在只能用packmol的前提下想出的一些笨办法。见笑了。 |
13楼2010-12-31 23:51:32
14楼2010-12-31 23:52:21
简单回复
黄石罐9楼
2010-12-19 12:53
回复
zyj8119(金币+1):谢谢参与
顶一下。










回复此楼