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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】安装packmol的comfigure怎么指定编译器？
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zyj8119

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】安装packmol的comfigure怎么指定编译器？

f the script was not able to find a suitable compiler, then you can manually set the compiler by:

./configure /path/to/your/compiler/yourcompiler
packmol网站上这么说，具体命令式？我的gfortran放在/usr/bin/gfortran
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1楼 2010-12-10 17:33:29
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cooloyyt

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-31 14:13:21
packmol设计的不太好，不能在指定分子取向的情况下随机分布分子，现在我是靠自己写的初始化程序配合它一块儿用，非常麻烦。
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10楼2010-12-30 23:29:17
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qphll

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
在你的path里面只要定义好了你的编译器, 就不需要担心这个了.

一般可以这样 (我的是bash, 以Intel Fortran):

(1) # vi ~/.bash_profile

增加这两句:

PATH=/users/qphll/simulation/intelfortran/bin:$PATH
export PATH

保存后, 运行这句使得你的修改立刻生效:

# . ~/.bash_profile

(2) # ifort

尝试调用ifort, 这个命令让你知道是否可以anywhere直接调用

(3) # which ifort
这个命令让你double check 系统path里面的调用路径,是不是你想要的那个命令.
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3楼2010-12-11 02:19:41
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zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by qphll at 2010-12-11 02:19:41:
在你的path里面只要定义好了你的编译器, 就不需要担心这个了.

一般可以这样 (我的是bash, 以Intel Fortran):

(1) # vi ~/.bash_profile

增加这两句:

PATH=/users/qphll/simulation/intelfortran/bin: ...

不能用gfortran吗？
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4楼2010-12-11 09:33:19
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qphll

金虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-18 20:33:57
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2010-12-11 09:33:19:

不能用gfortran吗？

你只需要类推就可以了...
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-12-11 10:26:47
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