| 查看: 1764 | 回复: 13 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】安装packmol的comfigure怎么指定编译器？
|
|||
|
f the script was not able to find a suitable compiler, then you can manually set the compiler by: ./configure /path/to/your/compiler/yourcompiler packmol网站上这么说，具体命令式？我的gfortran放在/usr/bin/gfortran |
回复此楼» 猜你喜欢
孩子确诊有中度注意力缺陷
已经有9人回复
-
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有3人回复
-
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有4人回复
-
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
-
AI论文写作工具：是科研加速器还是学术作弊器？
已经有3人回复
-
2026博士申请-功能高分子，水凝胶方向
已经有6人回复
-
论文投稿，期刊推荐
已经有4人回复
-
硕士和导师闹得不愉快
已经有13人回复
-
请问2026国家基金面上项目会启动申2停1吗
已经有5人回复
-
同一篇文章，用不同账号投稿对编辑决定是否送审有没有影响？
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
【求助】安装最后license的时候出问题
已经有4人回复- 【分享】[04-12]精挑细选绿色软件推荐下载[清清心整理]【已搜索无重复】
已经有2人回复
- 【求助】谁能帮我解决在linux下安装ms出现的问题啊
已经有8人回复
- 【求助】ms在win7下安装出现的问题，希望大家帮帮忙哦
已经有13人回复
- 【求助】MS5.5的license失效了
已经有16人回复
- 【求助】在Win 7 上安装Materials studio 出现下面错误怎么办
已经有3人回复
- 【求助】如何增加matlab的内存
已经有1人回复
- 【求助】linux/MS中Gateway安装出错
已经有10人回复
- 封贴【求助】Accelrys Materials Studio 4.4安装出现问题
已经有4人回复
- 【求助】Materials Studio 5.0 linux license安装出问题了
已经有3人回复
- 【求助】ms5.0 安装问题？？？
已经有1人回复
- 【求助】Materials-studio4.4安装问题
已经有1人回复
- 【求助】程序出错
已经有4人回复
- 【求助】linux 下安装 Materials Studio 到底是用root，还是普通用户
已经有2人回复
- 【求助】MS4.4linux安装license错误
已经有8人回复
- 【求助】MS测试时出错
已经有4人回复
- 【求助】MS4.4安装错误
已经有7人回复
- 【求助】linux下安装MS软件不成功
已经有9人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
双一流大学湘潭大学“化工过程模拟与强化”国家地方联合工程研究中心招收各类博士生
+1/100
-
中科院理化所(北京)招收2026年材料学外招博士生1名（考核制）
+1/78
-
北京化工大学生命科学与技术学院岗位招聘信息
+1/65
-
双一流大学湘潭大学“化工过程模拟与强化”国家地方联合工程研究中心招收各类博士生
+1/44
-
医学检验方向招收申请考核博士研究生
+2/38
-
国家青年人才叶立群教授课题组招收2026级博士研究生
+1/37
-
国家青年人才叶立群教授课题组招收2026级博士研究生
+1/36
-
上海交通大学智能颗粒流体团队 招收工程AI计算方向科研助理、博士生及博士后
+1/35
-
捷克布拉格查理大学(QS260)招收第一性原理计算方向博士生
+1/34
-
招收2026年生物类博士
+1/32
-
中山大学院士团队王来源教授课题组招聘博士后
+2/18
-
招募懂有限元、编程能力强的同学，待遇优厚
+1/15
-
南京大学能源与资源学院蔡亮课题组诚招2026年申请-考核制博士生2-3名
+1/10
-
美国圣母大学张艳良教授诚招全奖博士生
+2/8
-
长江大学武汉校区诚招工程热物理、油气、电气等新能源博士-2025
+1/5
-
香港城市大学 Microsystems and Semiconductor Technology Lab 博士生招生启事
+1/5
-
有没有一款可以听文献的APP
+1/4
-
清华大学化学系王梅祥院士课题组招聘博士后
+1/2
-
上海交通大学 Jaehyung Ju 课题组招收2026年申请考核博士生1 名
+1/1
-
鲜样可以直接检测吗？
+1/1
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+3):没有啊，很好啊，你的算法思想很好。。。。 2010-12-31 23:52:45
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-04 17:20:15
zyj8119(金币+3):没有啊，很好啊，你的算法思想很好。。。。 2010-12-31 23:52:45
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-04 17:20:15
|
我是做液晶的，我简单说一下我的解决办法，比较笨，也算土法炼钢了 我的要求是，希望体系中所有液晶都有固定的取向，然后和另外一个组分（比如说球）混合。 我的办法是，自己生成一个充满取向一致的液晶的盒子，当然空间也是规则排列的。然后用packmol生成一盒子随机排列的球，数目为最终体系需要的数目，数目然后自己写个程序把这两组坐标读进去，然后做个距离判据，如果一个液晶和球相距小于阈值，就把该液晶删了，最终体系的数密度会比设定的偏差一点，这时候没办法只能调整调整模拟盒子的大小了。 关于packmol的fix选项，在我的印象里，一个inp里面fix的分子数不能超过10个还是20个，也就是说你希望体系里所有的分子的取向或者坐标都按照你的设置来排列的话，分子数不能超过一个数量。这时候可以采用这样的办法，分几步来，先把十几个固定的分子生成一个小的块，然后把小块当做一个分子，复制几块变成大块，最后摆成最终的构型。比如说生成一个两相体系，可以先分别生成其中一相构成的“块”，再把两块读入进去后看成两个大分子拼在一起。 这都是在只能用packmol的前提下想出的一些笨办法。见笑了。 |
13楼2010-12-31 23:51:32
★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
|
在你的path里面只要定义好了你的编译器, 就不需要担心这个了. 一般可以这样 (我的是bash, 以Intel Fortran): (1) # vi ~/.bash_profile 增加这两句: PATH=/users/qphll/simulation/intelfortran/bin:$PATH export PATH 保存后, 运行这句使得你的修改立刻生效: # . ~/.bash_profile (2) # ifort 尝试调用ifort, 这个命令让你知道是否可以anywhere直接调用 (3) # which ifort 这个命令让你double check 系统path里面的调用路径,是不是你想要的那个命令. |
3楼2010-12-11 02:19:41
4楼2010-12-11 09:33:19
5楼2010-12-11 10:26:47