| 查看: 2190 | 回复: 13 | |||
[交流]
【求助】安装packmol的comfigure怎么指定编译器?
|
|||
|
f the script was not able to find a suitable compiler, then you can manually set the compiler by: ./configure /path/to/your/compiler/yourcompiler packmol网站上这么说,具体命令式?我的gfortran放在/usr/bin/gfortran |
» 猜你喜欢
filecode
已经有9人回复
请教兼职经验
已经有3人回复
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有39人回复
职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊
已经有5人回复
咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否
已经有13人回复
小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊
已经有11人回复
读博的好处
已经有4人回复
filecode
已经有17人回复
FileCode能看出啥?
已经有32人回复
我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人
已经有15人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
【求助】安装最后license的时候出问题
已经有4人回复
【分享】[04-12]精挑细选绿色软件推荐下载[清清心整理]【已搜索无重复】
已经有2人回复
【求助】谁能帮我解决在linux下安装ms出现的问题啊
已经有8人回复
【求助】ms在win7下安装出现的问题,希望大家帮帮忙哦
已经有13人回复
【求助】MS5.5的license失效了
已经有16人回复
【求助】在Win 7 上安装Materials studio 出现下面错误怎么办
已经有3人回复
【求助】如何增加matlab的内存
已经有1人回复
【求助】linux/MS中Gateway安装出错
已经有10人回复
封贴【求助】Accelrys Materials Studio 4.4安装出现问题
已经有4人回复
【求助】Materials Studio 5.0 linux license安装出问题了
已经有3人回复
【求助】ms5.0 安装问题???
已经有1人回复
【求助】Materials-studio4.4安装问题
已经有1人回复
【求助】程序出错
已经有4人回复
【求助】linux 下安装 Materials Studio 到底是用root,还是普通用户
已经有2人回复
【求助】MS4.4linux安装license错误
已经有8人回复
【求助】MS测试时出错
已经有4人回复
【求助】MS4.4安装错误
已经有7人回复
【求助】linux下安装MS软件不成功
已经有9人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
2026年财务管理、经济与信息技术国际会议 (FMEIT 2026)
+1/964
原创销售写了20年终于完结发表
+1/514
上海一恒贝茵公司全国均可联系销售或售后服务
+1/514
上海男征女 条件优秀可加微信联系
+1/447
武汉女征男
+2/188
毛细管流变仪,DSC, 力学性能,注塑、挤出、平板硫化机等成型与测试
+1/88
主流离心机品牌横评
+1/87
中国科学院空天院精密干涉测量团队 精密机械结构工程师招聘启事
+1/86
中国科学院空天院精密干涉测量团队招聘光学/算法/机械方向博士后/特别研究助理
+1/84
广东医科大学博士后招聘-基础医学,生信等方向
+1/38
物理学报录用,散币感谢合作者和审稿人
+2/34
无机非金属材料科学相关 实习研发人员招聘
+1/31
天津大学环境学院童银栋教授招收博士后(生源要素循环/温室效应/新污染物方向)
+1/30
中国石油大学(华东)计算机科学与技术学院/智能化新能源系统设计和开发方向 特聘副教
+2/26
同济大学环境学院肖倩课题组2026年补充招收推免生
+1/6
天津大学张小岩教授团队招收2027级推免生(光电子能源、热管理材料与器件、微纳传感)
+1/3
中山大学计算数学方向招2027届考核制博士生
+1/3
北理工集成电路杰青团队 | 诚招科助理
+1/3
苏州大学能源学院管大秦课题组诚聘博士后及招收博士/硕士研究生
+1/2
中国科学院地理资源所陆地表层格局与模拟院重点实验室招聘特别研究助理(博士后)
+1/1
2楼2010-12-11 00:49:09
★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
zyj8119(金币+1):谢谢参与
zh1987hs(金币+3):thank you 2010-12-11 09:36:26
|
在你的path里面只要定义好了你的编译器, 就不需要担心这个了. 一般可以这样 (我的是bash, 以Intel Fortran): (1) # vi ~/.bash_profile 增加这两句: PATH=/users/qphll/simulation/intelfortran/bin:$PATH export PATH 保存后, 运行这句使得你的修改立刻生效: # . ~/.bash_profile (2) # ifort 尝试调用ifort, 这个命令让你知道是否可以anywhere直接调用 (3) # which ifort 这个命令让你double check 系统path里面的调用路径,是不是你想要的那个命令. |
3楼2010-12-11 02:19:41
4楼2010-12-11 09:33:19
5楼2010-12-11 10:26:47
6楼2010-12-11 19:54:56
7楼2010-12-18 12:41:37
8楼2010-12-18 16:05:05
10楼2010-12-30 23:29:17
11楼2010-12-31 00:06:55
12楼2010-12-31 17:34:02
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zyj8119(金币+3):没有啊,很好啊,你的算法思想很好。。。。 2010-12-31 23:52:45
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-04 17:20:15
zyj8119(金币+3):没有啊,很好啊,你的算法思想很好。。。。 2010-12-31 23:52:45
ghcacj(金币+10):谢谢 2011-01-04 17:20:15
|
我是做液晶的,我简单说一下我的解决办法,比较笨,也算土法炼钢了 我的要求是,希望体系中所有液晶都有固定的取向,然后和另外一个组分(比如说球)混合。 我的办法是,自己生成一个充满取向一致的液晶的盒子,当然空间也是规则排列的。然后用packmol生成一盒子随机排列的球,数目为最终体系需要的数目,数目然后自己写个程序把这两组坐标读进去,然后做个距离判据,如果一个液晶和球相距小于阈值,就把该液晶删了,最终体系的数密度会比设定的偏差一点,这时候没办法只能调整调整模拟盒子的大小了。 关于packmol的fix选项,在我的印象里,一个inp里面fix的分子数不能超过10个还是20个,也就是说你希望体系里所有的分子的取向或者坐标都按照你的设置来排列的话,分子数不能超过一个数量。这时候可以采用这样的办法,分几步来,先把十几个固定的分子生成一个小的块,然后把小块当做一个分子,复制几块变成大块,最后摆成最终的构型。比如说生成一个两相体系,可以先分别生成其中一相构成的“块”,再把两块读入进去后看成两个大分子拼在一起。 这都是在只能用packmol的前提下想出的一些笨办法。见笑了。 |
13楼2010-12-31 23:51:32
14楼2010-12-31 23:52:21
简单回复
黄石罐9楼
2010-12-19 12:53
回复
zyj8119(金币+1):谢谢参与
顶一下。










回复此楼