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【求助】量子化学方法求amber力场参数
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| 用量子化学方法计算力场的参数,我自己解了一套,可跑完动力学,都跑散了,可能主要是二面角的参数不合适。请做过计算参数的多多指教,谢过! |
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2楼2010-11-21 21:45:12
3楼2010-12-16 15:51:32
4楼2010-12-16 15:51:56
5楼2010-12-16 15:52:25
6楼2010-12-16 16:36:21
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xinglaidor(金币+2):谢谢参与
xinglaidor(金币+2):谢谢参与
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实际并不复杂。这个拟合CHARMM力场参数的教程对于拟合AMBER力场二面角参数也很有借鉴意义: http://dogmans.umaryland.edu/~kenno/tutorial/ 主要注意的是电荷模型的不同,amber用RESP,并且勿忘1-4静电作用项。 |
7楼2010-12-17 02:14:46
8楼2010-12-17 10:44:21
9楼2012-06-06 15:30:22
10楼2012-06-06 15:31:46
11楼2012-12-17 15:58:46










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