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【求助】量子化学方法求amber力场参数
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xinglaidor
金虫
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[交流]
【求助】量子化学方法求amber力场参数
用量子化学方法计算力场的参数,我自己解了一套,可跑完动力学,都跑散了,可能主要是二面角的参数不合适。请做过计算参数的多多指教,谢过!
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2010-11-21 21:21:20
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sobereva
至尊木虫
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★
xinglaidor(金币
+2
):谢谢参与
实际并不复杂。这个拟合CHARMM力场参数的教程对于拟合AMBER力场二面角参数也很有借鉴意义:
http://dogmans.umaryland.edu/~kenno/tutorial/
主要注意的是电荷模型的不同,amber用RESP,并且勿忘1-4静电作用项。
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7楼
2010-12-17 02:14:46
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abing_1981
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xinglaidor(金币
+2
):谢谢参与
感觉这个还要多参考文献吧.
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2楼
2010-11-21 21:45:12
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boylc789
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xinglaidor(金币
+2
):谢谢参与
这个我看过有些是自己拟合出力场的
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3楼
2010-12-16 15:51:32
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boylc789
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xinglaidor(金币
+2
):谢谢参与
你可以搜搜中文的硕博论文
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5楼
2010-12-16 15:52:25
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