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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】体系的minimizer 目的是什么？
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】体系的minimizer 目的是什么？ 已有5人参与

跟朋友讨论这个minimizer这个问题

      我们对晶体、分子单个都是最小化的  但对于将二者放到一个体系中时 是不是先要最小化 出现了分歧  比如 分子在某个晶体某个面的吸附过程的体系

     我一直都是先最小化的  目的就是让体系能量处于最低点 使得体系稳定  然后再dynamic

     但我的朋友却这么做  他先dynamic  如果出错了 就minimizer 他认为  dynamic就是一个体系逐渐稳定过程  根据模拟的时间长短 找到相对平衡的模拟结果  所以之前的minimize 不是必须的

     我想自己对于分子模拟的本质还是不太清楚   

              我想请教下大家  MM是不是必须的？
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1楼 2010-11-12 20:14:31
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xdr

金虫 (正式写手)
★ ★
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ym23(金币+1):谢谢参与 2010-11-13 10:25:10
我觉得，minimize之后再dynamic，更容易达到稳定。
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2楼2010-11-13 08:57:01
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
我也想知道答案，帮你顶一下
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博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
3楼2010-11-13 10:27:52
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)
★
sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-11-13 23:46:17
跟老师讨论了一下   老师认为MM 不是必须的  dynamic也是通过力场是体系达到平衡
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4楼2010-11-13 20:36:03
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wangth08

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
sunyang1988(金币+2):谢谢交流 2010-11-13 23:46:39
引用回帖:
Originally posted by cg陈 at 2010-11-12 20:14:31:
跟朋友讨论这个minimizer这个问题

      我们对晶体、分子单个都是最小化的  但对于将二者放到一个体系中时 是不是先要最小化 出现了分歧  比如 分子在某个晶体某个面的吸附过程的体系

     我一直都是先最 ...

你老师说的对，最小化不是说作动力学必须的。一般最小化是首先达到一个合理的结构，然后动力学的话更容易达到稳定状态。有时候不最小化的时候，计算动力学会出错，提醒你两步之间的能量差超过了设定的值。这时候最小化一下，就不会出现这个问题了。所以说最小化不是必须要做的。动力学自己计算是会达到稳定的状态的。
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5楼2010-11-13 21:44:20
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qasd

木虫 (著名写手)
★ ★
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sunyang1988(金币+1):谢谢交流 2010-11-13 23:46:51
minimize仅是为了消除粒子重叠，如果体系粒子不重叠，那么可以不做
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6楼2010-11-13 22:41:24
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