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Nocturne

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于加H问题已有2人参与

我在XP命令后 N原子加H
使用命令HADD
精修过后,发现其中一个H的位置发生变化,
我用Diamond分别打开.ins   .res和cif文件
发现分子间距离不一样,相差较大,请问这是什么原因?
精修过后和之前的H原子位置为什么发生变化?
谢谢!!
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乐此不疲

木虫 (正式写手)


wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-11-06 07:37:11
先根据键长看看,那个N的序号几,假如是N1
那你就在XP里输入 bang N1
看看与N1相连的Q峰有没有1.01A;左右的,有的话就差不多这个Q峰就是那个氢了,下面是一个键长数据网站
http://www.wiredchemist.com/chem ... ergies_lengths.html
如果不行修改INS文件的PLAN 默认是20 你把它改大,有可能那个Q峰太弱没有出来。希望对你有帮助,如果还出不来那我也不知道咋弄了······
7楼2010-11-05 21:46:49
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乐此不疲

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-11-06 07:35:58
建议LZ,把这个N上的氢删掉用差值傅里叶找氢找找看
2楼2010-11-05 20:28:30
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Nocturne

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 乐此不疲 at 2010-11-05 13:28:30:
建议LZ,把这个N上的氢删掉用差值傅里叶找氢找找看

请问用什么命令?
谢谢!
我对有机分子加氢不太熟悉
3楼2010-11-05 20:33:29
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zqfkkd

铁杆木虫 (正式写手)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-11-06 07:36:14
二楼正解,对于数据质量还可以的晶体。N或游离水上的H,建议傅里叶寻氢。
4楼2010-11-05 20:35:45
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