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Nocturne

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于加H问题 已有2人参与

我在XP命令后 N原子加H
使用命令HADD
精修过后,发现其中一个H的位置发生变化,
我用Diamond分别打开.ins   .res和cif文件
发现分子间距离不一样,相差较大,请问这是什么原因?
精修过后和之前的H原子位置为什么发生变化?
谢谢!!
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zqfkkd

铁杆木虫 (正式写手)

wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-11-06 07:36:14
二楼正解,对于数据质量还可以的晶体。N或游离水上的H,建议傅里叶寻氢。
4楼2010-11-05 20:35:45
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乐此不疲

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-11-06 07:35:58
建议LZ,把这个N上的氢删掉用差值傅里叶找氢找找看
2楼2010-11-05 20:28:30
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Nocturne

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 乐此不疲 at 2010-11-05 13:28:30:
建议LZ,把这个N上的氢删掉用差值傅里叶找氢找找看

请问用什么命令?
谢谢!
我对有机分子加氢不太熟悉
3楼2010-11-05 20:33:29
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乐此不疲

木虫 (正式写手)


Nocturne(金币+1):谢谢! 我试了下,不可以我通过Q峰找H找不到,根据键长 2010-11-05 21:15:53
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-11-06 07:36:42
主体结构找完之后,先在ins文件里加入anis然后找氢。比较确定H位置的就用HADD命令。不确定的,就做几次XL指认N原子旁边合适的Q峰为H(用bang命令看看键长),这就是差值傅里叶找氢。因为XL就是对结构模型进行差值傅里叶合成计算和最小二乘法精修的。
5楼2010-11-05 20:46:05
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