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Nocturne

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[交流] 【求助】关于加H问题已有2人参与

我在XP命令后 N原子加H
使用命令HADD
精修过后，发现其中一个H的位置发生变化，
我用Diamond分别打开.ins .res和cif文件
发现分子间距离不一样，相差较大，请问这是什么原因？
精修过后和之前的H原子位置为什么发生变化？
谢谢！！

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1楼2010-11-05 20:17:58

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引用回帖:

Originally posted by 乐此不疲 at 2010-11-05 13:28:30:
建议LZ，把这个N上的氢删掉用差值傅里叶找氢找找看

请问用什么命令？
谢谢！
我对有机分子加氢不太熟悉

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3楼2010-11-05 20:33:29

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我试了下，不可以我通过Q峰找H找不到，根据键长，我的晶体质量不好。

引用回帖:

Originally posted by 乐此不疲 at 2010-11-05 13:46:05:
主体结构找完之后，先在ins文件里加入anis然后找氢。比较确定H位置的就用HADD命令。不确定的，就做几次XL指认N原子旁边合适的Q峰为H（用bang命令看看键长），这就是差值傅里叶找氢。因为XL就是对结构模型进行差值 ...

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6楼2010-11-05 21:32:10

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3x
我的骨架确定了，就是加H的问题

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9楼2010-11-05 21:54:24

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我把PLAN 放到最大
只有26个残余峰
envi N1
没有发现合理的键长，看来数据不好

引用回帖:

Originally posted by 乐此不疲 at 2010-11-05 14:50:59:

一个H解不出来，就不是晶体质量不好，晶体质量不好连主体结构都出不来的。我前几天也有一个晶体，光找一个氢就找了好长时间.如果你自己实在解不出来就找老师让他帮你解

[ Last edited by 乐此不疲 on 2010- ...

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10楼2010-11-05 22:00:37

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