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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请教有关DNA测序问题，请高手不吝赐教，万分感激
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ccyw

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】请教有关DNA测序问题，请高手不吝赐教，万分感激 已有1人参与

本人非生物专业，现在需要测两株酵母菌株的DNA序列，联系了一个测序公司，说可以通过质粒测出DNA序列，不过要提供载体类型、抗性，以及片段长度这些东西，我完全是个门外汉，不知道对于酵母菌株来说，这些应该如何选择，还请高手一定救我啊！谢过先！

另外，不知道用质粒做DNA测序是否准确呢？看了好多文献好像都用的16srDNA呢。
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要数就输给追求，要嫁就嫁给幸福
1楼 2010-10-27 17:43:44
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
ccyw(金币+5):谢谢先，请高手继续解答啊 2010-10-28 18:56:23
ccyw(金币+1): 2011-01-12 09:25:35
你想干什么，想知道菌是什么属还是怎么的？不会是全基因组测序吧，一般做菌种鉴定可以用16S
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2楼2010-10-27 18:08:07
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷
ccyw(金币+1): 2011-01-12 09:25:40
公司的意思貌似要你做个18srDNA测序，扩增后做下克隆。
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Thank-you，so-blue.
3楼2010-10-27 18:30:16
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ccyw

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-10-27 18:08:07:
你想干什么，想知道菌是什么属还是怎么的？不会是全基因组测序吧，一般做菌种鉴定可以用16S

不是想测菌属，就是想测基因组序列呢。我也觉得没必要做全基因组测序，只是不知道要测哪部份呢？因为我对酵母的基因组不清楚呢
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要数就输给追求，要嫁就嫁给幸福
4楼2010-10-28 14:55:19
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ccyw

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2010-10-27 18:30:16:
公司的意思貌似要你做个18srDNA测序，扩增后做下克隆。

他说的是通过质粒测呢
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要数就输给追求，要嫁就嫁给幸福
5楼2010-10-28 14:55:57
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
ccyw(金币+2): 2011-01-12 09:25:26
是不是让你做PCR，扩增18S，做克隆，再提质料测序~~
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6楼2010-10-28 15:09:10
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷
ccyw(金币+10):非常感谢 2010-10-28 18:55:46
ccyw(金币+1): 2011-01-12 09:25:55
引用回帖:
Originally posted by ccyw at 2010-10-28 14:55:57:


他说的是通过质粒测呢

做克隆，就是为了用质粒测嘛。
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Thank-you，so-blue.
7楼2010-10-28 15:31:05
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ccyw

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2010-10-28 15:31:05:

做克隆，就是为了用质粒测嘛。

哦，那请问要如何选择载体和基因片段那些呢？
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要数就输给追求，要嫁就嫁给幸福
8楼2010-10-28 18:54:00
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dfl204

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
dhd997(金币+2):谢谢交流。 2010-10-28 19:34:08
ccyw(金币+5):非常感谢高手指点，请继续帮忙啊 2010-10-29 09:38:20
ccyw(金币+5): 2011-01-12 09:25:08
估计你选的公司也不是很了解你的情况。

酵母的基因组信息绝大多数应该是在公共数据库里能找到的，你如果对其中的一部分感兴趣可以设计引物扩增以后连接到载体上去测序。

如果你是做两个酵母菌株的比较基因组学的话，就不能选择一般的测序手段。现在重测序的技术非常发达，只要肯花钱，几个月的时间就可以测完，这个课题就有点大了。
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9楼2010-10-28 19:02:55
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ccyw

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by dfl204 at 2010-10-28 19:02:55:
估计你选的公司也不是很了解你的情况。

酵母的基因组信息绝大多数应该是在公共数据库里能找到的，你如果对其中的一部分感兴趣可以设计引物扩增以后连接到载体上去测序。

如果你是做两个酵母菌株的比较基因组 ...

听高手这么一说，大概有个了解了，就是我需要先查询酵母的基因组信息，找到表达我想要的性能的基因片段，然后拿去做这一段基因片段的DNA提取、PCR扩增，最后测序？

其实我还想问问，就是做对比基因组序列的话，可行性大不大？比如母代和表观性能发生突变的子代之间，DNA序列会不会不同？
嘿嘿，说了这么多，求解惑啊！
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要数就输给追求，要嫁就嫁给幸福
10楼2010-10-29 09:44:21
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