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aloon111

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何作16S rDNA聚类/进化图? 已有7人参与

看文献的聚类分析图,不知道是如何作出来的?还有上面的数字是怎么标上去的?有序列,有软件,但我就是做不出那个样子的图来。如《番茄叶霉菌拮抗放线菌的筛选、鉴定及发酵条件研究》这篇文章里的聚类分析图,请问大虾们这图是怎么做出来的。先谢谢大家了。
这个是如下:
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汇天下之贤
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minfeng0608

新虫 (初入文坛)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
PHYLIP,MEGA4.0都可以的,那些数字是自举1000次以后生成的,是置信区间,一般大于50%的可信。。。
5楼2010-11-17 21:14:52
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

数字不是标上去的大哥,数字是利用N-J法构树的时候自动生成的,其意义类似于置信区间这样的一个概念,往往50%以下的部分都不要的。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2010-10-27 13:54:36
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aloon111

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-27 13:54:36:
数字不是标上去的大哥,数字是利用N-J法构树的时候自动生成的,其意义类似于置信区间这样的一个概念,往往50%以下的部分都不要的。

兄弟,会做的话步骤怎么做的啊?谢谢啦。。
汇天下之贤
3楼2010-10-27 13:59:20
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
。。。。。。。网上教程很多的,自己找下吧,还是图文教程。我习惯用MEGA 4.0 做系统发育树的图。。。。。。自己先试试看。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
4楼2010-10-27 14:01:37
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