应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】如何作16S rDNA聚类/进化图？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
91/1返回列表
查看: 1807  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

aloon111

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】如何作16S rDNA聚类/进化图？ 已有7人参与

看文献的聚类分析图，不知道是如何作出来的？还有上面的数字是怎么标上去的？有序列，有软件，但我就是做不出那个样子的图来。如《番茄叶霉菌拮抗放线菌的筛选、鉴定及发酵条件研究》这篇文章里的聚类分析图，请问大虾们这图是怎么做出来的。先谢谢大家了。
这个是如下：
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
汇天下之贤
1楼 2010-10-27 13:39:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
数字不是标上去的大哥，数字是利用N-J法构树的时候自动生成的，其意义类似于置信区间这样的一个概念，往往50%以下的部分都不要的。
赞一下 回复此楼
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2010-10-27 13:54:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aloon111

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-27 13:54:36:
数字不是标上去的大哥，数字是利用N-J法构树的时候自动生成的，其意义类似于置信区间这样的一个概念，往往50%以下的部分都不要的。

兄弟，会做的话步骤怎么做的啊？谢谢啦。。
赞一下 回复此楼
汇天下之贤
3楼2010-10-27 13:59:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
。。。。。。。网上教程很多的，自己找下吧，还是图文教程。我习惯用MEGA 4.0 做系统发育树的图。。。。。。自己先试试看。
赞一下(1人) 回复此楼
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
4楼2010-10-27 14:01:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

minfeng0608

新虫 (初入文坛)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
PHYLIP，MEGA4.0都可以的，那些数字是自举1000次以后生成的，是置信区间，一般大于50%的可信。。。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-11-17 21:14:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxh6166

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
是啊，挺简单的，我刚做过
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-11-21 10:12:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gjs713

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
用 几个软件结合起来做 效果挺好的。
先用 DNAMAN比对 修饰序列后，在用CLUSTER生成序列文件，最后在MEGA中生成系统树。你所说的数字 并不是自己标上去的，而是 在MEGA中自举检验你所做的系统树的置信度后所反映的值。
赞一下(1人) 回复此楼
勤奋、执着、专注，则无坚不破。
7楼2010-11-21 10:23:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小新jiayang

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-27 13:54:36:
数字不是标上去的大哥，数字是利用N-J法构树的时候自动生成的，其意义类似于置信区间这样的一个概念，往往50%以下的部分都不要的。

用MEGA软件建树时使用Bootstrap检验，可生成打分
赞一下 回复此楼
8楼2010-11-23 13:28:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑藻先生

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1523432楼: Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-27 13:54:36
数字不是标上去的大哥，数字是利用N-J法构树的时候自动生成的，其意义类似于置信区间这样的一个概念，往往50%以下的部分都不要的。

我跟导师商量的怎么觉得75%以上的才可信 也就是说50%太少了点=。=
赞一下 回复此楼
9楼2012-11-09 11:24:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 aloon111 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 08工科求调剂286 +3 tgs_001 2026-03-28 3/150 2026-03-29 18:29 by 1018329917
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +5 hanamiko 2026-03-29 5/250 2026-03-29 16:46 by 学员8dgXkO
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +7 李李不服输 2026-03-26 7/350 2026-03-29 16:25 by 学员8dgXkO
[考研] 求收留 +5 1943443204 2026-03-28 5/250 2026-03-29 12:11 by 无际的草原
[考研] 数一英一271专硕（085401）求调剂，可跨 +7 前行必有光 2026-03-28 8/400 2026-03-28 23:22 by 小木虫tim
[考研] 322求调剂 +7 宋明欣 2026-03-27 7/350 2026-03-28 21:27 by sanrepian
[考研] 本科新能源科学与工程，一志愿华理能动285求调剂 +7 AZMK 2026-03-28 11/550 2026-03-28 21:01 by xxxsssccc
[考研] 一志愿华理，数一英一285求A区调剂 +8 AZMK 2026-03-25 12/600 2026-03-28 18:15 by AZMK
[考研] 299求调剂 +7 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 7/350 2026-03-28 13:09 by 唐沐儿
[考研] 291求调剂 +6 HanBeiNingZC 2026-03-24 6/300 2026-03-28 07:55 by baoball
[考研] 287求调剂 +10 land xuxu 2026-03-26 10/500 2026-03-27 15:33 by 帕尔马拉特
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-25 7/350 2026-03-27 14:47 by 狂炫麦当当
[考研] 085600，材料与化工321分调剂 +4 大馋小子 2026-03-27 6/300 2026-03-27 14:11 by 松花缸1201
[考研] 求调剂，一志愿 南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕 +4 @taotao 2026-03-26 5/250 2026-03-27 08:10 by hypershenger
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 290分调剂求助 +3 吉祥止止陈 2026-03-25 3/150 2026-03-25 19:58 by barlinike
[考研] 296求调剂 +4 汪！？！ 2026-03-25 7/350 2026-03-25 16:41 by 汪！？！
[考研] 293求调剂 +7 加一一九 2026-03-24 7/350 2026-03-25 12:02 by userper
[有机交流] 有机合成求助 20+3 FENGSHUJEI 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:31 by 88817753
[论文投稿] 急发核心期刊论文 +3 贤达问津 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:13 by 妹子不好惹
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭