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04swlcm

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】定点突变-DpnI消化 已有8人参与

大家好:
      我最近做定点突变,采用反向PCR方法扩整个质粒+基因片段(突变位点设计在两互补的突变引物中间),高保真酶跑20个循环,直接在20uLPCR产物中加入1uLDpnI消化3h,取10uL转化JM109,涂Amp平板,一颗菌未长,郁闷中,请大家帮忙!这种突变方法需要注意些什么呢?
     请问DpnI消化前或后需要纯化吗?我没有,好些资料上也说不需要纯化。
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chinosaur

木虫 (正式写手)

求购IQ卡


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
楼上的好像完全不懂定点突变的原理啊!去找个官方的介绍看看再说吧。
我做过不少点突变,各种各样的,同时突变几个的,加进去的,减少的,随意改变连续7个以内氨基酸残基的我都做过,一次成功率几乎100%,应该说这种方法是非常强大的。关键就在PCR这步,我做的时候会按照protocol上做对照,如果你PCR做出来的条带比对照的明显亮很多,那基本上就成功了。
引物的设计也是关键,原protocol上说的引物设计方法效率非常差,最好的设计方法是两条引物3端分别突出一段。这两个地方弄好了,基本上就没问题了。

另外,DpnI消化之前不用纯化,直接把酶加到反应体系里混匀然后放37度就行了。推荐转化时用DMT菌株,这种菌株有和DpnI相似的功能,能把模板链消化掉,使成功率更加接近100%。如果没有这种菌株,可以将酶切时间从1小时延长到2-3个小时。

[ Last edited by chinosaur on 2010-11-3 at 15:12 ]
http://www.99zihua.com/images/20100123/56.gifhttp://hi.baidu.com/chinosaur招行充话费:http://shop.cmbchina.com/shop/chonghuafei.aspx
9楼2010-11-03 15:06:18
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查看全部 13 个回答

月月大可

木虫 (著名写手)


04swlcm(金币+1):谢谢参与
感觉问题不是出在消化这一步了。消化不好应该有菌落长出来才对!

认为是在PCR扩增问题。
3楼2010-10-22 12:34:56
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04swlcm

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by 月月大可 at 2010-10-22 12:34:56:
感觉问题不是出在消化这一步了。消化不好应该有菌落长出来才对!

认为是在PCR扩增问题。

那请问怎么样检测是否PCR扩增出问题了?谢谢
4楼2010-10-22 13:42:31
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墨香若水

木虫 (著名写手)

小小囧虫


04swlcm(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by 04swlcm at 2010-10-22 13:42:31:




那请问怎么样检测是否PCR扩增出问题了?谢谢

P完跑胶看是否有质粒大小条带。确认P出来了再消化。
仕不可不弘毅,任重而道远
5楼2010-10-22 13:52:22
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