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wzh上善若水

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】vasp优化晶格参数a 已有8人参与

vasp优化晶格参数a,侯柱峰教程中:
准备好一个poscar文件,得到Volume-Etotal的数据,运行脚本程序
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 3.80 3.85 3.90 3.95 4.00 4.05 4.10 4.15 4.20 4.25 4.30
do
cat > POSCAR < Al-fcc
$i
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
0.5 0.5 0.0
1
Direct
0.0 0.0 0.0
!
echo / a = $i angstrom /; time vasp
E=‘grep /TOTEN0 OUTCAR | tail -1 | awk -{printf /%12.6f \n0, $5 }.‘
V=‘grep /volume0 OUTCAR | tail -1 | awk -{printf /%12.4f \n0 , $5}.‘
echo $V $E >>EtVo.dat
done
小弟菜鸟,请问如何运行脚本
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1003307944

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢指教 2010-10-22 08:22:05
你这个脚本执行的时候可能会算,但是有多人提交任务的时候,你的任务会被停止,,还不如把这个脚本中对参量的改变,采用手动的方式,算完一个,再变动下。。
5楼2010-10-21 21:09:14
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1003307944

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
bingmou:什么意思? 2010-10-21 19:44:43
除非你一个人用超算计算机
3楼2010-10-21 17:03:47
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
bingmou(金币+1):感谢交流 2010-10-21 19:44:07
先学习一下linux的的基本操作。运行脚本,首先要保证脚本有执行权限
$chmod 777 filename
$./filename
4楼2010-10-21 17:06:50
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xiaowu787

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
还有两个问题
V=‘grep /volume0 OUTCAR | tail -1 | awk -{printf /%12.4f \n0 , $5}.‘
运行脚本后,这个命令没有得到预期结果,不知道那里出错?
grep "TOTEN" OUTCAR |tail -1|awk '{printf "%12.6f   ",$5}'
可以正常运行并得到结果,只是没有“V=”

time的意义在这里是什么?
期待高手指点一下

[ Last edited by xiaowu787 on 2010-10-25 at 12:41 ]
6楼2010-10-25 12:36:31
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