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zhang668

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请问侯博士,

计算E-V曲线时候遇到这个问题。我的EtVo.dat文件里每个V,E结果出现的次数和并行节点数一样,不是只出现一次。不知道问题出现在哪里?下面是我的程序:
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 3.37 3.42 3.47 3.52 3.57 3.62 3.67 3.72 3.77 3.82 3.87 3.92 3.97 4.02 4.07 4.12 4.17 4.22
do
cat > POSCAR < BiFeO3
$i
1 0 0
0 1 0
0 0 1
3 1 1
Direct
0.5 0.5 0
0.5 0 0.5
0 0.5 0.5
0.5 0.5 0.5
0 0 0
!
~/vasp
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk  '{printf  "%12.6f \n", $5}'`
V=`grep "volume" OUTCAR | tail -1 | awk  '{printf  "%12.4f \n", $5}'`


还有得到E,V数值后,写个inp.m,用murn.x out.m 命令时一直没成功,提示:no star: incomprehensible list input
apparent state: unit 5 (unnamed)
last format: list io
lately reading sequential formatted external IO
Aborted
然后也没生成fout.dat文件.
请问这个怎么回事?
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zhang668

木虫 (正式写手)

★ ★
franch: 金币+2, 鼓励交流。 2013-11-26 00:54:04
引用回帖:
5楼: Originally posted by guogencai at 2013-11-24 13:15:23
楼主请问下你最后怎么处理的啊,我现在初学,也遇到这个问题,我用ulimit -s unlimited 命令也没有用,我已经纠结几天了,望解答,谢谢。。。

这个是并行计算就会出现的,出现次数跟节点数一样。
6楼2013-11-25 09:57:59
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查看全部 8 个回答

valenhou001

至尊木虫 (职业作家)


zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-10-13 13:10:31
此脚本不能用于并行计算。只适合串行的计算。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2010-10-13 09:29:11
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zhang668

木虫 (正式写手)

哦,多谢!请问后面拟合状态方程时出现的错误大概是什么问题?就是no star: incomprehensible list input
apparent state: unit 5 (unnamed)
last format: list io
lately reading sequential formatted external IO
Aborted
然后也没生成fout.dat文件.
3楼2010-10-13 11:13:13
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-10-13 15:33:44
ym23(金币+2):欢迎常来交流 2010-10-13 18:48:41
很久就不此工具,发现不好用了了。错误的信息可能是输入文件没有准备好。推荐用此贴提到的工具:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2056902%A1%A3
4楼2010-10-13 14:55:38
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