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Superox

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】请教：如何分析Zdock的对接结果？ 已有4人参与

Zdock的对接操作比较简单，但对接生成的结果只有复合物的结构文件，如何对其进行分析呢？Zdock有没有自带的分析工具，或者应该使用其他软件分析呢？谢谢！
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1楼 2010-10-08 15:36:28
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Superox

新虫 (初入文坛)
附：Zock对接结果.out文件部分，请教其每列的物理意义，谢谢！

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2.380392        2.500101        -0.120466
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2楼2010-10-10 09:37:14
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cuiqin0704

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问楼主现在知道怎么分析这个数据了吗，小虫现在也开始做这个，不知道怎么分析啊？
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3楼2014-05-26 10:31:01
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me_creazy

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by Superox at 2010-10-10 09:37:14
附：Zock对接结果.out文件部分，请教其每列的物理意义，谢谢！

112        1.2
2.380392        2.500101        -0.120466
rec.job29560.bl.pdb        3.136        26.932        -21.625
lig.job29560.bl.pdb        -5.263        15.238        -22.691
-3.141593        2.37 ...

Zdock的分析结果，在zdock的网页上有查看说明，LZ可以去看一下，最后一列代表的是ZDOCK的打分数值
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4楼2015-11-24 16:06:32
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1054950560

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你可以把对接结果使用fiberdock这个来进行打分，也可以使用Rdock来分析，有一本书叫蛋白质预测结构指南，那里面介绍了Zdock和Rdock联合使用的情况，其实Zdock有自身的打分功能，不过要根据你想要的对接结果来自行选择，打分高的并不一定表示对接结果合理
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努力就会有回报，不管是好的还是坏的
5楼2015-11-26 15:07:35
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