应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】dmol过渡态确认
71/1返回列表
查看: 2008  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

charityqi

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】dmol过渡态确认 已有1人参与

1。
如果用TS opt进行过渡态的优化后，该怎么确认这是真正的过渡态呢，或者说怎么用TS confirmation？谢谢大家。
2。
对于过渡态只能有一个虚频吗？还是说多余的频率强度小于多少就可以接受呢？谢谢大家
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-09-28 21:18:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lovemydog

银虫 (小有名气)
★ ★
charityqi(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-10-05 09:55:08
charityqi(金币+1): 2010-10-08 21:06:50
要用TS confirmation确认的。过渡态只能有一个虚频，而且绝对值大于100才比较可靠
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-10-05 09:42:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

charityqi

木虫 (小有名气)
谢谢，那做TS CONFIRMATION 时需要轨迹文件，用TS opt的轨迹文件并不是从反应物到生成物的呀？
引用回帖:
Originally posted by lovemydog at 2010-10-05 09:42:12:
要用TS confirmation确认的。过渡态只能有一个虚频，而且绝对值大于100才比较可靠

赞一下 回复此楼
3楼2010-10-08 21:06:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liancsh

铜虫 (小有名气)
★ ★
charityqi(金币+1):谢谢参与
sunyang1988(金币+1): 谢谢指点 2011-03-12 10:56:35
引用回帖:
Originally posted by charityqi at 2010-10-08 21:06:40:
谢谢，那做TS CONFIRMATION 时需要轨迹文件，用TS opt的轨迹文件并不是从反应物到生成物的呀？

做TS CONFIRMATION 时需要的轨迹文件是TS Search 过程中产生的xtd文件，而不是TS optimization 过程中的轨迹文件。
TS optimization 是一个精炼过渡态的过程，要想在Demol中确定过渡态是不能用它的路径文件的。
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2011-03-12 08:28:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tangbohejin

木虫之王 (文学泰斗)
★
charityqi(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by liancsh at 2011-03-12 08:28:37:
做TS CONFIRMATION 时需要的轨迹文件是TS Search 过程中产生的xtd文件，而不是TS optimization 过程中的轨迹文件。
TS optimization 是一个精炼过渡态的过程，要想在Demol中确定过渡态是不能用它的路径文件的。

支持----
回复此楼
5楼2011-03-12 12:22:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qdykswang

金虫 (著名写手)
★
charityqi(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by liancsh at 2011-03-12 08:28:37
做TS CONFIRMATION 时需要的轨迹文件是TS Search 过程中产生的xtd文件，而不是TS optimization 过程中的轨迹文件。
TS optimization 是一个精炼过渡态的过程，要想在Demol中确定过渡态是不能用它的路径文件的。...

First of all, when your QST finishes, set up the TS Confirmation but click 'save files' instead of 'run.' It will create a folder with a name like <name> DMol3 TSConf with the files <name>_reac.car, <name>_prod.car, and <name>_intm.car. Delete the file <name>_intm.car. Leave that folder be for the moment, and go run your TS optimization. When it finishes, get the .car file and copy it into the DMol3 TSConf folder with the name <name>_intm.car. Finally, open the input file in DMol3 TSConf, and select 'Run Files' on the DMol3 dialog. This will fool DMol3 into using your own TS structure.
赞一下 回复此楼
化学工程+高分子
6楼2013-12-10 22:52:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

溪水永恒

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by qdykswang at 2013-12-10 22:52:56
First of all, when your QST finishes, set up the TS Confirmation but click 'save files' instead of 'run.' It will create a folder with a name like <name> DMol3 TSConf with the files <name&g ...

我试了下，怎么运行不了？
赞一下 回复此楼
7楼2014-11-28 21:21:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 charityqi 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料类求调剂 +9 wana_kiko 2026-02-28 10/500 2026-03-01 17:01 by sunny81
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 10/500 2026-03-01 16:53 by caszguilin
[考研] 0856材料求调剂 +4 麻辣鱿鱼 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:51 by caszguilin
[考研] 材料学硕318求调剂 +8 February_Feb 2026-03-01 10/500 2026-03-01 16:48 by sunny81
[考研] 0805总分292，求调剂 +4 幻想之殇 2026-03-01 4/200 2026-03-01 16:47 by ms629
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[考研] 材料化工调剂 +9 今夏不夏 2026-03-01 10/500 2026-03-01 16:01 by hmn_wj
[考研] 0856调剂 +4 刘梦微 2026-02-28 4/200 2026-03-01 15:35 by 吸一口猫气
[考研] 材料工程274求调剂 +3 Lilithan 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:58 by ms629
[考研] 303求调剂 +4 今夏不夏 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:46 by 嘟嘟小浣熊
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 材料学调剂 +8 提神豆沙包 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:14 by peike
[考研] 306分材料调剂 +3 chuanzhu川烛 2026-03-01 4/200 2026-03-01 12:32 by houyaoxu
[考研] 272求调剂 +5 材紫有化 2026-02-28 5/250 2026-03-01 11:51 by gaoxiaoniuma
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +6 Soliloquy_Q 2026-02-28 11/550 2026-03-01 11:14 by 歌liekkas
[考研] 寻找调剂 +4 LYidhsjabdj 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:56 by sunny81
[考研] 272求调剂 +4 田智友 2026-02-28 4/200 2026-03-01 06:43 by 刘兵
[考研] 307求调剂 +4 73372112 2026-02-28 6/300 2026-03-01 00:04 by ll247
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭